Beberapa masalah kesehatan organ pernapasan yang dapat dialami manusia diantaranya:
a. Faringitis, radang pada faring karena infeksi
b. Dipteri, infeksi pada saluran lernapasan bagian atas.
c. SARS, SARS adalah sebuah penyakit pernapasan yang disebabkan virus Coronavirus dari ordo Coronavirudae yang menginfeksi saluran pernapasan.
d. Bronkitis, berupa peradangan pada selaput lendir dari saluran bronkial. Sementara itu pleuritis adalah leradangan pada pleura,lapisan pelindung yang membungkus paru-paru.
e. Asma, merupakan gangguan pada sistem pernapasan dengan gejala sukar bernapas.
f. Emfisema, merupakan peradangan pada permukaan dalam alveolus.
g. Kanker paru-paru, disebabkan oleh kelainan sel pada epitel bronkial.
h. Infeksi Saluran Pernapasan Akut (ISPA), merupakan infeksi yang menyerang tenggorokan, hidung dan paru-paru.