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血液型への影響予測 - Coggle Diagram
血液型への影響予測
膜蛋白解析
DeepTMHMM
・予測(膜貫通部位、細胞外領域、細胞内領域)
・変異前後比較
TMHMM
DeepTMHMMと併用
Phobius
膜貫通+シグナルペプチド
発現量予測
AlphaMissense
蛋白機能喪失予測
MutPred2
評価(発現低下、リン酸化変化、機能変化)
EVE
アミノ酸置換の影響予測
タンパク相互作用
HADDOCK
ドッキング
ClusPro
複合体解析
PRODIGY
結合自由エネルギー
発現量を左右するRNA解析
SpliceAI
exon skipping
cryptic splice
Human Splicing Finder
補助的
MNSplice
スプライシング予測
安定性解析
FoldX
ΔΔG、ミスセンス変異の影響
Rosetta
変異効果、リモデリング、相互作用面
タンパク質品質管理
Aggrescan3D
予測(凝集、misfolding)
CamSol
溶解性予測
糖鎖修飾解析
NetNGlyc
GPA/GPBで重要
N結合糖鎖
NetOGlyc
GPA/GPBで重要
O結合糖鎖
保存性解析
ConSurf
保存されている残基か