Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
VIRUS CHE INFETTANO BATTERI (BATTERIOFAGI) - Coggle Diagram
VIRUS CHE INFETTANO BATTERI (BATTERIOFAGI)
I PRINCIPALI TIPI DI VIRUS BATTERICI
Morfologia di tre fagi modello
Struttura e genoma
La curva di crescita "one-step" (a un solo passo)
Cosa succede dentro la cellula durante la latenza
Il ciclo replicativo di un virus batterico (5 fasi)
I recettori dei batteriofagi
fagi prototipo
, cioè i fagi modello più studiati:
T4, T7, φX174, M13, MS2, Mu, λ
FAGO T4 (Classe I – dsDNA)
Il batteriofago T4 di Escherichia coli
Attacco di T4 alla parete di E. coli e iniezione del DNA
Andamento temporale dell'infezione di T4 (circa 25 minuti a 37 °C)
La base speciale del DNA dei fagi T pari: 5-idrossimetilcitosina
Generazione in T4 di molecole di DNA lunghe un genoma con sequenze permutate
Impacchettamento dei genomi fagici: λ vs T4
Impacchettamento del DNA nella testa di T4
Assemblaggio del fago T4
Assemblaggio di T4 (fasi dell'impacchettamento)
FAGO T7 (Classe I – dsDNA)
Mappa genetica di T7: funzioni chiave
Replicazione del genoma lineare a dsDNA di T7
FAGO φX174 (Classe II – ssDNA)
Mappa genetica di φX174
Flusso di eventi nella replicazione di φX174
Replicazione a cerchio rotante (rolling circle) di φX174
FAGO M13 (Classe II – ssDNA, filamentoso)
Ciclo replicativo di M13
Slide 32–33 – Assemblaggio di M13 e uscita SENZA lisi
FAGO MS2 (Classe IV, RNA a singolo filamento positivo)
Il fago a RNA MS2 e il flusso degli eventi
Mappa genetica di MS2
FAGO Mu (temperato, si sposta come un trasposone)
Mappa genetica del fago Mu
Integrazione di Mu nel DNA dell'ospite
FAGO λ (LAMBDA): MODELLO DI FAGO TEMPERATO
λ è il fago temperato più studiato: dopo l'infezione può scegliere tra
ciclo litico
e
ciclo lisogeno**.
Ciclo di infezione di un fago temperato
Il ciclo vitale di λ (schema completo)
1. Espressione dei geni precoci immediati (entro 3–5 minuti)
2. Espressione dei geni precoci ritardati (dopo 3–5 minuti)
Regolazione dell'attivazione di PRE: la scelta tra litico e lisogeno
Il repressore cI
--- è
sia repressore sia attivatore
e
CRO
Struttura dell'operatore destro (OR)
Regolazione dell'espressione di cI e cro
Legame cooperativo di cI
Perché la cooperatività è importante: risposta "a interruttore"
COME cI e CRO RICONOSCONO IL DNA
Come agisce la proteina N
Integrasi e Xis: controllo per retroregolazione
3. Geni tardivi (late)
Il ciclo replicativo di λ
La via litica di λ (passaggi numerati)
Replicazione del DNA di λ
Impacchettamento
La via di assemblaggio di λ
I promotori di λ
Il ciclo litico
Confronto tra ciclo lisogeno e ciclo litico
Schema riassuntivo della decisione
Regolazione degli eventi litici e lisogeni in λ (esperimento su singole cellule)
INSTAURAZIONE DELLA LSIOGENIA
Il mantenimento della lisogenia
- circuito autoregolato
Integrazione del DNA di λ nel cromosoma dell'ospite
Escissione
: uscita del profago dal cromosoma, che torna DNA autonomo
Induzione
: passaggio dal lisogeno al
ciclo litico
, (profago passa alla via litica) causato dalla
distruzione del repressore
della lisogenia → escissione (es. dopo
raggi UV
)
La lisogenia in natura
Integrazione ed escissione: ricombinazione sito-specifica
ulteriore spiegazione
Mappa genetica e molecolare di λ
Immunità dei fagi λ
-- capacità di un profago di
impedire che un altro fago dello stesso tipo
infetti la cellula (il repressore già presente blocca il nuovo DNA)
Il meccanismo della risposta SOS
Taglio del repressore cI da parte di RecA attivata (induzione)
Confronto tra elementi genetici indipendenti presenti nei batteri