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EVOLUZIONE MICROBICA E SISTEMATICA - Coggle Diagram
EVOLUZIONE MICROBICA E SISTEMATICA
SISTEMATICA E TASSONOMIA
COS'è LA SISTEMATICA?
Tabella delle tecniche e livello tassonomico
Caratteristiche fenotipiche utili in tassonomia
Esempio di identificazione classica:
E. coli
Test API 20E
Analisi degli acidi grassi (FAME)
Principali metodi genotipici
Intervalli di GC nei vari organismi
Ibridazione DNA-DNA
Ribotipizzazione e MLST
MLST: perché serve
CRONOMETRI EVOLUTIVI E FILOGENESI MICROBICA
rRNA 16S
SSU rRNA nei tre domini
Sequenziare il 16S da una coltura pura
Sequenziamento Sanger
Costruire un albero filogenetico dal 16S
Come si legge un albero
Esempio di albero di Ralstonia
Phyla dei batteri
L'albero universale della vita (Woese)
Effetti del trasferimento genico orizzontale sull'albero
Sequenze firma (signature sequences)
Sonde fluorescenti e FISH
Analisi della biodiversità di una comunità microbica
EVOLUZIONE MICROBICA
il processo evolutivo
Core genome e pan genome
CONCETTO DI SPECIE E NOMENCLATURA
definizione di specie procariota
Rapporto tra 16S e ibridazione DNA-DNA
Come nasce una nuova specie batterica
Quante specie esistono
Gerarchia tassonomica
CARATTERISTICHE DEI TRE DOMINI
Parete cellulare
Lipidi di membrana
RNA polimerasi
Tabella riassuntiva delle differenze
MICRORGANISMI PRIMITIVI E ORIGINE DELLA VITA
Le tappe principali dell'evoluzione
Camini idrotermali e origine della vita
Dal mondo a RNA alla cellula moderna
Come producevano energia le prime cellule
Microfossili batterici
e origine cellula eucariote