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GENETICA MICROBICA - Coggle Diagram
GENETICA MICROBICA
PLASMIDI
Esempi di plasmidi naturali e dei caratteri che conferiscono
Ogni plasmide è presente nella cellula in un numero caratteristico di copie
Plasmidi per la degradazione di inquinanti
Incompatibilità tra plasmidi
L’evoluzione della resistenza in Shigella in Giappone
Il fattore F e il plasmide R a confronto
La mappa del plasmide R100 (circa 94 kb)
Il plasmide ColE1 (circa 6,6 kb)
Il plasmide pBR322: un vettore di clonaggio
Come si clona un gene in pBR322
Un vettore moderno: pET-30a(+)
TRASFERIMENTO GENICO ORIZZONALE
TRE MECCANISMI DI TRASFERIMENTO ORIZZONTALE
LA TRASFORMAZIONE
L’esperimento di Avery, MacLeod e McCarty (1944): il principio trasformante è il DNA
CELLULA COMPETENTE
---> colei che assorbe il DNA
La regolazione della competenza: sistema a due componenti
Competenza e quorum sensing
Il meccanismo della trasformazione nei Gram+
La trasformazione nei Gram−: Haemophilus influenzae
L’apparato di ingresso del DNA: Gram+ e Gram−
Terreno selettivo e mutanti auxotrofi: come si “vedono” i trasformati
Il DNA durante la trasformazione: un esperimento con la DNasi
A cosa serve la trasformazione naturale?
CONIUGAZIONE
La scoperta (Lederberg e Tatum, 1946)
L’esperimento del tubo a U (Davis): serve il contatto
Il trasferimento del plasmide F
La mappa genetica del plasmide F (circa 99 kb, 99.159 paia di basi)
TRASFERIMENTO IN DETTAGLIO
I componenti Mpf (Mating-pair formation)
---> proteine che costruiscono l’apparato di coniugazione
I componenti Dtr (DNA transfer and replication)
I ceppi Hfr e il trasferimento del cromosoma
Come si integra il plasmide F
I diversi ceppi Hfr
Selezionare i ricombinanti
L’esperimento della coniugazione interrotta: la mappa in minuti
La mappa di E. coli in minuti
Coniugazione verso gli eucarioti: Agrobacterium e il plasmide Ti
Agrobacterium tumefaciens e il plasmide Ti
Il trasferimento del T-DNA nella pianta, passo per passo
Il plasmide Ti come strumento di ingegneria genetica
Come si ottiene una pianta transgenica
TRASDUZIONE
---> trasferimento di DNA tramite fagi
TRASDUZIONE GENERALIZZATA
esempio
FAGI P1 E P22
TRASDUZIONE SPECIALIZZATA
COME FUNZIONA?
La particella λdgal
SISTEMA SOS
--> come viene indotto un PROFAGO
CONVERSIONE LISOGENICA
CONFRONTO TRA I DUE TIPI DI TRASDUZIONE
RIASSUNTO
TRASPOSONI
STRUTTURA DEI TRASPOSONI
La duplicazione della sequenza bersaglio
DUE MECCANISMI DI TRASPOSIZIONE
1. TRASPOSIZIONE CONSERVATIVA
taglia e incolla
Tn7, conservativa
2. TRASPOSIZIONE REPLICATIVA
copia e incolla
La trasposizione replicativa e il cointegrato (Tn3)