Please enable JavaScript.

Coggle requires JavaScript to display documents.

Modificaciones de Histonas, La lisina tiene un grupo amino libre y con…

- - - - Argininas
        
        Mono o dimetiladas, ya se asimetrica o simetricamente.
      - Lisinas
        
        Pueden estar mono, di o tri metiladas.
      - Histidinas
        
        Solo pueden estar mono-metiladas
- - - - Demetilasas
        
        Son enzimas encargadas de remover grupos metilo en residuos con la marca. Hay 3 principales familias:
        
        Metilación de Lisinas. Pueden metilar también no-histonas
        
        Dioxigenasas dependientes de hierro, con el dominio jumonji C (JmjC)
        
        Aminoxidasas
        
        Metilación de argininas
        
        Proteina arginina deaminasa Tipo IV (PADI4). Transforma la arginina metilada el citrulina, aunque también puede actuar sobre argininas no metiladas.
      - Metiltransferasas
        
        Son enzimas encargadas de metilar los residuos, o mover los grupos metilo de lugar. Pueden metilar las histonas asociadas a la cromatina, pero también histonas libres y no histonas. Hay 3 principales familias:
        
        Metilación de lisinas
        
        Proteínas con dominio SET
        
        Proteínas DOT-1 like
        
        Metilación de argininas
        
        Familia de proteínas N-metiltransferasa de la arginina (PRMT)
- - - - Marcas asociadas a la compactación de la cromatina y a la restricción de la transcripción. Estas marcas hacen que las moléculas del nucleosoma se atraigan entre sí y hagan que se junten, haciendo así que el genoma no quede expuesto para factores de transcripción. Más importante aún, la carga neta es positiva, lo que favorece la unión de la hebra de ADN al nucleosoma.
        
        H3K27me3
      - Marcas relacionadas con la relajación de la cromatina y promoción de la transcripción. Estas marcas hacen que las moléculas del nucleosoma se repelan entre sí. Más importante aún, la carga neta es negativa, lo cual hace que el nucleosoma repela la hebra de ADN (carga neta negativa también.)
        
        H3K4me3 (Trimetilación en la lisina 4 de la histona 3)
        
        Asociado con regiones de enhancers en el ADN.
        
        H3K4me1
        
        Asociado con regiones promotoras en el ADN.
      - Marcas con actividades contrarias o combinatorias. Algunas marcas pueden reprimir o activar la transcripción dependiendo de las proteínas que tengan asociadas, siendo muy dependientes de las combinaciones entre otras marcas y la unión a complejos proteicos con múltiples dominios que permiten la unión de varias marcas de metilación.
        
        H3K4me2, H3K4me3
        
        Aunque usualmente relacionadas con la apertura de la cromatina, cuando están unidas a la proteína corepresora con dominio PHD miembro 2 de la familia de inhibidores del crecimiento (ING2) se relacionan con la represión de la transcripción por la estabilización de un complejo de histonas deacetilasas.
        
        H3K4me3 y H3K27me3
        
        Aunque están asociadas con la represión y activación de la cromatina respectivamente, en conjunto promueven la transcipción de varios grupos de genes.
- - - - Se ha encontrado usos para el mantenimiento de la pluripotencia y proliferacion, haciendo accessibles los promotores y enhancers de genes como OCT4, NANOG.
      - Se ha encontrado que durante la diferenciación de las ESC (Células troncales embrionarias) se disminuye la presencia de listonas con esta modificación
    - - La marca H4K8ac se encuentra significativamente enriquecida en las regiones promotoras e intergénicas de genes de identidad celular (como Hes5 y Gpr17).
  - - - La marca H3K27me3 y H3K9 están relacionadas con la silenciación de genes que promueven la pluripotencia, así como con la determinación de linaje en el desarrollo embrionario. Así, dependiendo de que genes estén reprimidos por estas marcas de metilación es el destino celular que toma la célula en diferenciación. De forma interesante, la marca H3K9 está relacionada con un nivel aún mayor de silenciación debido a su interacción estrecha con la lamina basal del nucleo (heterocromatina constitutiva). De esta forma, se reorganiza la cromatina para silenciar y activar genes de manera específica. La forma en la que esto pasa aún no se comprende del todo.
    - - Las marcas de metilación en H3K4, H3K9, H3K27, H3K36, H3K79 y H4K20me2 está relacionadas con la respuesta al daño al ADN, especialmente cuando se trata de cortes en doble cadena (DSB). La forma más común en la que se logra es reprimiendo los sitios donde hubo un DSB solucionado usando non-homologous end joining (NHEJ).