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Génétique, Exo ou endoribonucléases en grands nombre, Mécanismes multiples…
Génétique
Régulation post-transcriptionnelle : Stabilité des ARNm
Dégradation des ARNm
Différentielle
Exemple
S.aureus, l'expression de saeP et Q dépendent de l'activité de l'endoriobonucléase RNase de l'endoriobonucléase RNaseY
Retour à l'état normal après induction
Demi-vie courte --> régulation efficace
Dépendance de la transcription mais aussi de la dégradation
Stabilisation des ARNm
Interaction protéine-ARNm (RBS)
Induction d'un encombrement stérique empêchant le dégradasome ou la RNase d'acceder à l'ARNm
Plus on a de ribosomes fixé plus l'ARNm est protégé
sRNA
Favorise ou inhibe la dégradation de l'ARNm
Interactions CIS ou TRANS
Modification de l'ARNm
Modification de l'extrémité 5'
Régulation Traductionnelle
Initiation
Recrutement de la petite sous-unité sur la séquence Shine-Dalgarno ou RBS par complémentarité avec ARN 16S
Exemple : Séquence consensus E. coli 5’-AGGAGGU-3’
Démarrage de la traduction
ARNt couplé à une formyl-Met complémentaire de AUG
Riboswitch
Structure secondaire de l'ARm
Ligand nécessaire
Vitamines
AA
ions
Types
Non-Nucleotytic Repression Mechanism (thiM and btuB riboswitch)
Nucleotytic Repression mechanism (lysC riboswitch)
Elongation
Cycle d'élongation
Arrivée d’un ARNt-AA dans le site A
Transfert du polypeptide sur l’AA
Translocation sur l’ARNm
Détachement de l’ARNt vide
Terminaison
Codon STOP
UGA
Aucun AA
UAA
UAG
Release Factor se fixent au site et reconnait les codons STOP
=>libération du peptide et dissociation du ribosome
Vitesse de Traduction
Ralentissement des ribosomes
Pénurie d’ARNt-AA nécessaires
Séquence ribonucléique => structure secondaire
Séquence protéique => encombrement stérique des AA (peptide d’arrêt)
Rappel
Définition
Régulon : ensemble des gènes régulés par un régulateur
Stimulon : ensemble des gènes régulés par le même stimulus (signal)
Opéron : ensemble des gènes dépendant du même promoteur
Transcription
ARNpol se fixant sur les séquence régulatrices (-35, -10)
Terminaison : présence d'un terminateur de transcription
Rho dépendant
Rho indépendant
Traduction
Ribosomes + ARNt
Régulation post-Traductionnelle
Régulation quantité de protéines
Dégradation des protéines
Recyclage des protéines (turnover)
Indispensable à la survie bactérienne
Elimination des protéines mal repliées ou dégradées
Régulation de l'activité enzymatique
Modification post-transcriptionnelle la plus fréquente : phosphorylation
Modification allostérique
Enzymes non modifiées mais interaction non covalente avec une autre
molécule
• site actif inhibé
• changement de structure
Exo ou endoribonucléases en grands nombre
Mécanismes multiples et complexes
