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放射性药物研究项目 - Coggle Diagram
放射性药物研究项目
结构化实验抽取
文献层
primary_studies
研究类型
研究对象
来源与证据等级
分子实体层
放射性核素
配体/抗体/肽
螯合剂
连接子
可切割性
分子尺寸
电荷
疏水性
结构修饰
实验设计层
动物种属与模型
肿瘤模型
给药方式
剂量与活度
采样时间点
样本处理
分析方法
观察值层
血液动力学
肿瘤摄取
肾摄取
肾脏滞留
肾脏清除
肝脾等器官分布
肿瘤/背景比
时间轨迹
代谢物层
尿液代谢物
肾脏保留分析物
体外底物切割产物
完整偶联物切割产物
代谢来源与位置
结构化文件
experiments.jsonl
entities.jsonl
observations.jsonl
metabolites.jsonl
primary_studies.csv
五条科学实验主线
01 肾脏滞留
肾脏通路
再吸收
持续滞留
代谢物来源
清除策略
02 诊断成像窗口
肿瘤时间轨迹
背景时间轨迹
TBR变化
最佳成像时间
成像窗口权衡
03 肿瘤-OAR选择性
肿瘤暴露
正常器官暴露
综合暴露
治疗窗口
分子设计权衡
04 跨家族泛化
家族定义
结构—动力学关系
activity cliff
OOD
family-held-out
适用域
05 临床前—人体转化
动物PK
人体成像/剂量
动力学表型
候选物排序
跨物种差异
转化边界
多路线文献筛选
全库/PETBD摘要筛选
相关性判断
文献角色分类
纳入/排除
半衰期导向高价值筛选
半衰期字段识别
High
Medium/Review
Low
Exclude
结构与体内行为筛选
肾脏滞留
肿瘤/OAR分布
代谢与清除
结构修饰与连接子
筛选审计
批次缺失检查
总数核对
标签语义核对
高价值文献并集
全文优先级队列
全文获取与下载
开放全文
PMC
XML/全文页面
补充材料
受限全文
出版社页面
机构访问
InstSci/代理路线
本地文件路线
本地PDF候选检索
标题/作者人工匹配
DOI/PMID下载队列
下载管理
按出版社拆分队列
失败重试
仍缺失全文清单
PDF覆盖率统计
全文解析与证据定位
文件转换
PDF转文本
XML解析
图表与补充材料
重点章节
Methods
Animal study
Biodistribution
Pharmacokinetics
Metabolism
Urine
Kidney
证据提取
原文证据片段
页码/段落
表号
图号/图注
文献—证据—字段映射
工具与产出
MinerU解析
解析结果复核
evidence extraction记录
匹配系列与机制比较
匹配策略
同配体不同螯合剂
同骨架不同连接子
可切/不可切连接子
不同分子尺寸
不同电荷
不同疏水性
比较前标准化
统一单位
统一时间点
统一器官定义
统一终点定义
区分绝对与相对差值
肾脏机制证据
体外底物切割
完整偶联物切割
尿液代谢物
肾脏保留分析物
肾摄取与肾滞留关系
清除改善与肿瘤摄取损失权衡
比较边界
同研究内优先
实验条件一致才配对
禁止跨条件强行比较
matched_pairs.csv
建模与验证
数据集分层
Tier A高质量数据集
去重
污染同步
分层建模视图
基线与误差
非结构化基线
Tier A基线
靶向QC
假阳性/假阴性分析
泛化验证
OOD验证
family-held-out验证
时间外验证
prospective validation
候选排序稳定性
不确定性
不确定性校准
适用域
证据稀疏区域
不可泛化结论
最终产出
数据产出
结构化证据数据库
experiments/entities/observations/metabolites
matched-pair数据集
模型就绪数据集
文献产出
高价值文献并集
全文覆盖审计
缺失PDF下载清单
DOI/PMID队列
科学产出
肾脏滞留结论
成像窗口结论
肿瘤-OAR选择性结论
跨家族泛化结论
动物—人体转化结论
研究空白与证据缺口
归档产出
report-source.md
run_manifest.json
search_log.csv
claim_source_ledger.jsonl
gap_matrix.csv
ZIP/TAR可复现项目包
研究框架
总体目标
分子/模块设计
多器官体内分布
时间依赖动力学表型
决策与临床前转化
五条科学主线
肾脏滞留与肾脏通路
诊断肿瘤/背景动力学与成像窗口
治疗性肿瘤/OAR暴露选择性
跨分子家族结构—体内行为泛化
临床前到人体动力学表型转移
方法学准备
纳入与排除标准
实验字段定义
证据等级规则
Claim-to-source规则
项目目录、模板、Schema、Runbook
文献全集建立
数据来源
PubMed/API
PMID、标题、摘要、期刊、年份、DOI
全文链接与开放获取状态
数据处理
批次下载
批次合并
唯一PMID核对
重复记录去除
DOI/PMID规范化
产出
候选文献数据库
search_log.csv
文献元数据表
PDF身份与全文审计
身份核验
标题
作者
期刊
年份
DOI
PMID
文件类型核验
目标正文
补充材料
综述
被引用文献
错误PDF/错误DOI
审计结果
PDF身份审计表
全文覆盖表
UNKNOWN
evidence gap
人工裁决队列
证据与数据质量审计
科学证据
primary-study-first
claim-source ledger
citation audit
evidence quality summary
gap matrix
证据边界
区分摄取与滞留
区分滞留与毒性
区分摄取与疗效
保留负面证据
保留失败优化
保留矛盾结果
未证实结论标记UNKNOWN
数据审计
CSV完整性
JSONL Schema
字段缺失
非法配对
数据泄漏
训练/验证污染
复核与版本迭代
发现问题
文献身份冲突
数值冲突
代谢物分类冲突
研究条件不可比
回溯处理
回到原始全文
补充文献
补充PDF
重新解析
重新抽取
重新匹配
版本化
更新实验记录
更新实体记录
更新观察记录
更新代谢物记录
重新运行审计
v002/v003等版本