Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Energi sel dan vesicular traffic - Coggle Diagram
Energi sel dan vesicular traffic
Endocytosis
Konsep Dasar
Tujuan dan Fungsi
mengambil nutrisi
memasukkan cairan/partikel
mempertahankan kekebalan tubuh
Definisi
Pengambilan materi luar melalui pembentukan vesikel
Mekanisme Endocytosis
Jenis-Jenis Endocytosis
Pinocytosis
material
cairan & molekul kecil
mekanisme
vesikel kecil
Receptor-mediated endocytosis
material
molekul spesifik
mekanisme
reseptor & coat protein
Phagocytosis
mekanisme
membentuk phagosome
material
partikel besar
membutuhkan
Energi
GTP
menyediakan
energi untuk
aktivitas beberapa GTPase
ATP
menyediakan
energi untuk
aktivitas motor proteins
Mitokondria
Struktur
Membran dalam
Melipat ke dalam membentuk cristae
Terbentuknya ATP, sangat selektif dan kaya protein
Membran luar
Dapat berinteraksi dengan sitosol dan retikulum
endoplasma.
Mengandung porin, protein saluran besar yang
membuatnya permeabel terhadap molekul kecil
(≤10 kDa)
DNA Mitokondria
Bentuk sirkuler dan double-stranded,
Tidak dibungkus histon
mengandung 13 protein rantai respirasi, 22 tRNA, 2 rRNA
Ruang intermembran
diantara membran luar dan dalam
Mengandung enzim untuk transfer nukleotida
berperan pelepasan sitokrom c saat
apoptosis
Matriks mitokondria
bagian terdalam
Mengandung: Ribosom 70s, Enzim siklus asam sitrat, tRNA dan rRNA, mtDNA, koenzim A, NAD+, FAD
Fungsi
pada Membran dalam
tempat berlangsungnya Transpor elektron, Pemompaan proton, Fosforilasi oksidatif
Terjadinya proses ATP Sintase pada membran dalam
pada Ruang antar membran
Tempat akumulasi proton
membentuk gradien elektrokimia
Apoptosis dan ROS
Sinyal kematian Sel
Homeostasis Ca2+
Sinyal dan Buffer kalsium
Siklus Krebs
Oksidasi Asetil-KoA
Sekresi
yaitu
pengeluaran zat dari dalam sel ke ekstraseluler
jenis
Konstitutif
yaitu
Berlangsung terus-menerus tanpa sinyal
Terregulasi
yaitu
Disimpan dulu dan baru dilepas jika ada sinyal
Komponen Pembentukan Vesikel
COPII
yaitu
Mengangkut kargo anterograde
RE menuju cis-Golgi
COPI
yaitu
Mengangkut kargo retrograde
Golgi menuju RE
Clathrin
yaitu
Membentuk vesikel
dari Trans-Golgi Network ke endosom/ membran
Sinyal Penyortiran
Sinyal KDEL
Sinyal KKXX / DXE
Mannose-6-Phosphate
Organ terlibat
Rough Endoplasmic Reticulum
Transport Vesicles
Golgi Apparatus
Secretory Vesicles
Membran Plasma
Endosome
Lysosome
Tahap Awal Jalur Sekretori
Anterograde
yaitu
Pergerakan vesikel arah maju
Dimulai dari
Reticulum endoplasma
Badan golgi
Membran plasma
Retrograde
yaitu
Pergerakan vesikel arah mundur
Dimulai dari
Badan golgi
Reticulum endoplasma
Vesicular Traffix
Konsep Dasar
Definisi
Sistem pengangkutan materi seluler menggunakan kantung bermembran (vesikel) antar organel.
Fungsi Utama
Transportasi protein, lipid, dan enzim antar organel (misal: RE → Golgi → Membran Plasma).
Sekresi molekul keluar sel (Jalur Sekretori).
Pengambilan materi dari luar sel (Jalur Endositosis).
Menjaga identitas dan komposisi membran tiap organel.
Tahap Pembentukan & Transpor Vesikel
1. Inisiasi & Rekrutmen GTPase
Protein GTPase (Sar1/ARF1) diaktifkan oleh GEF dan menempel di membran donor.
2. Perakitan Selubung & Seleksi Kargo:
Inner coat (adaptor) mengenali sinyal penyortiran kargo.
Outer coat membentuk kerangka luar vesikel.
3. Pembentukan Tunas (Budding)
Perakitan selubung menyebabkan membran melengkung ke dalam.
4. Pemutusan (Fission)
Membran leher tunas dipotong hingga vesikel lepas.
5. Pelepasan Selubung (Uncoating)
Selubung protein dilepas agar vesikel siap berinteraksi dengan membran target.
6. Pengarahan & Fusi (Targeting & Fusion):
Protein Rab-GTP mengarahkan vesikel ke lokasi target (docking).
Interaksi v-SNARE (vesikel) + t-SNARE (target) memicu fusi membran untuk melepaskan kargo
Jenis-Jenis Coated Vesicles
Vesicle COPII
Vesicle COPI
Vesicle Clathrin