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HEMICORDADOS, Aporta edición genética precisa, Necesita eliminar factores…
HEMICORDADOS
Identifica elementos regulatorios (RNA-seq + ATAC-seq)
Su Atlas Cis Regulador
Desarrollo embrionario de Ptychodera flava
Programas bifásicos de desarrllo conservados
Accesibilidad de cromatina
Indica factores clave
Secuenciación de transcriptoma
Solo descriptivo, sin validación funcional in vivo
Introducir genes en Hemicordados
Minor - Transgénesis I - SecI
Expresión ubicua o regionalizada
Expresión en embriontes de saccoglossus kowalevskii
Permite evaluar elementos cis regulatorios in vivo
Microinyección de meganucleasa I-SecI
Construcciones con promotores
Eficiencia de inserción del 46%
Knockout de foxa con CRIPR-Cas9
POPSUJ - CRISPR/Cas9
Validación de mutaciones por secuenciación
Knockaout somático y de línea germinal en Ciona
Microinyección de complejosis Cas9-sgRNA
Protocolos transferibles a hemicordados
Diseño de ARN guía (sgRNA)
Permite eliminar FoxA y observar fenotipos de gastrulación
Demuestra conservación funcional
Perez posada sintaxis
Análisis de sintaxis de factores de transcripción
La lógica regulatoria se conserva por millones de años
Transgénesis cruzada
Valida elementos de hemicordados en otros modelos
Justifica uso de hemicordados en Biología sintética
ATAC-Sec comparativo en 4 deuterosomados
Aporta edición genética precisa
Necesita eliminar factores clave
Necesita validad Cis-reguladores
Aporta técnica de Transgénesis