El artículo 83 le otorgoó competencia al denominado Mecanismo Nacional de Prevención de la Tortura y otros Tratos Crueles, Inhumanos y Degradantes de ONU, ratificado. Esto determina la actuación de la INDDHH en el monitoreo de los lugares donde se encuentran personas que no pueden salir por su propia voluntad (centros carcelarios, hospitales psiquiátricos, centros de atención de adolescentes infractores o protección de niñas, niños y adolescentes y, en su caso, comisarías)
Desde 2017 recibió nuevas competencias: velar por los derechos de las personas institucionalizadas según la Ley de Salud Mental y participar en la aplicación de la Ley de Violencia basada en Género.
En 2018 se le otorgaron funciones relacionadas con la creación y declaración de sitios de memoria histórica
En 2019 asumió la búsqueda de personas detenidas desaparecidas durante el período de actuación ilegítima del Estado y la dictadura, investigando las circunstancias de su desaparición y la ubicación de sus restos.