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REPLICAZIONE - Coggle Diagram
REPLICAZIONE
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DNA elicasi
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ha una struttura ad anello che le permette di circondare un solo filamento e favorirne il disavvolgimento
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all'interno dell'anello sono presenti molecole d'acqua che agiscono da lubrificante, facilitando lo scorrimento
INIZIATORE
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funzioni
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piega e svolge una funzione di DNA adiacente al sito di legame favorendo l'apertura della doppia elica
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TELOMERI
sequenze di DNA altamente ripetitivo e non codificante (TTAGGG), situate alle estremità dei cromosomi
hanno un ruolo fondamentale nel preservare e proteggere il DNA codificante interno dall'accorciamento progressivo dei cromosomi
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FORCA REPLICATIVA
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è una struttura dinamica, che si sposta lungo il DNA in direzione 5'-3'
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RIMOZIONE DEGLI INNESCHI
PROCARIOTI
- l'enzima RNAsi H è un'esonucleasi che rimuove tutti i ribonucletodi del primer eccetto l'ultimo che viene rimosso dalla DNA polimerasi I
- la DNA polimerasi I sintetizza il gap, rimpiazzando il primer
- la DNA ligasi salda il nick, consumando ATP
3.1 reazione di adenilazione: legame esterico tra il fosfato del nucleotide e il fosfato alfa dell'ATP
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3.2 attacco dell'OH al 3' del frammento successivo sul fosfato del frammento precedente e formazione del legame fosfodiesterico
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EUCARIOTI
- RNA primasi che sintetizza il primer
- DNA polimerasi-alfa primasi che continua la sintesi del primer e svolge anche la funzione di polimerasi a bassa fedeltà
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- la polimerasi-alfa primasi perde affinità e si dissocia
- viene sostituita da una polimerasi altamente processiva e altamente fedele che allo stesso tempo rimuovono il primer misto con un "metodo ad apriscatola"
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questo switch avviene più volte nel filamento lento, una sola volta nel filamento veloce
- viene generato un flap, che viene rimosso da un'endonucleasi del flap (FEN)
- infine agisce la DNA ligasi per saldare l'ultimo legame
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MODELLO A TROMBONE
il filamento lento viene disavvolto e replicato con ritardo, generando un'ansa di grandezza variabile che ricorda la coulisse del trombone
su questo filamento agiscono in maniera alternata due core dell'oloenzima della polimerasi (il terzo è sul filamento veloce)
questa alternanza permette di sincronizzare la replicazione del filamento lento con quella del filamento veloce
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REPLICATORE
l'intero set di sequenze nucleotidiche agenti in cis sufficiente per dirigere l'inizio della replicazione
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ESEMPIO: E. Coli
le sequenze 13 MER sono sequenze di 13 nucleotidi, ricche di A e T che sono più facile da aprire
le sequenze 9 MER sono sequenze di 9 nucleotidi che costituiscono veri e propri siti di legame per l'iniziatore
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RNA primasi
è un tipo di RNA polimerasi che ha la funzione di sintetizzare brevi sequenze di RNA complementari allo stampo, chiamate primer
i primer servono perchè la DNA polimerasi non è in grado di iniziare la sintesi da zero, ma solo di estendere un filamento preesistente
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