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CROMATINA - Coggle Diagram
CROMATINA
regolazione epigenetica -> CODICE ISTONICO: INSIEME DI REGOLE BASATE SULLA MODIFICAZIONE DI ISTONI , CHE REGOLA L'ESPRESSIONE GENICA
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metilazione del DNA -> della 5 -metil - CITOSINA, che si trova nelle isole CpG -> regioni a monte del gene, lunghe 1000 pdb, ripetizioni di CG- la metilazione causa silenziamento dell'espressione genica.> inativaizone genica: iperametilazione. invece ipometilazione: attivazione genica. isole CpG sono a basso contenuto di H1 pereciò piu soggette a DNasi
processo dinamico e reversibile.
Enzimi
- di mantenimento -> metil transferasi costitutive: post replicative
- de novo: che intervengono durante lo sviluppo
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Impaccamento-> insieme di DNA, RNA, istoni e proteine non istoniche:
- DNA diametro 2 nm
- nucleosomi: diametro 11 nm, DNA avvolto attorno al core (ottamero) istonico per 1.7 volte, 146 pdb; nucleosomi uniti da DNA linker -> DNA nudo 80 nt.
- grazie all'istone H1 -> compattamento di file di 6 istoni in fibra da 30 nm ---> solenoide o zig zag
- impaccamento 300 nm
- impaccamento 700 nm metafase
istoni: proteine del core del nucleosoma sono i dimeri H2A-H2B e H3-H4. sono carichi positivamente. Le interazioni con il DNA sono INTERAZIONI ELETTROSTATICHE!<- isolabili con aggiunta sali in soluzione. Struttura: coda N terminale -> maggiormente soggetta a modificazioni covalenti dei residui a.a.: LYS metilazione, acetilazione, SER fosforilazione. Dominio centrale "histone fold", ripiegamento, permette ripiegamento dell'istone e formare la "stretta di mano" del dimero, formato da 3 alfa eliche e due regioni non strutturate. Coda al C terminale.
istone H1-> non fa parte del core istonico, ma permette l'impaccamnto della fibra da 30 nm. ha un core globulare, una coda C terminale più lunga e una N terminale corta. Con la C terminale prende contatto con il DNA linker; con core e N terminale con il nucleosoma (DNA e istoni). H1 -> modifica il percorso del DNA linker
variante CENP A -> variante di H3 nel centromero:
- non in tutti i nucleosomi nel centromero, sufficiente in 40-60 nucleosomi
- la localizzazione di CENP A determina la posizione del centromero
- essenziale per la funzionalità del centromero stesso> grazie al dominio CAT D -> funzioni del centromero: segregazione omologhi e assemblaggio del cinetocore. mutanti di CENP A non possono replicare-> non vitale.
- dimero H3 H4 ipoacetilato-> eterocromatina molto compatta per resistere alla forza di trazione
organizzazione della cromatina in un cromosoma:
- centromero con CenpA -> eterocr
- regioni pericentromeriche di eterocromatina
- bracci di eucromatina trascriz. attivi
assemblaggio del core istonico: dimero h3 h4 ; dimero H2a h2b
poi i due h3 si uniscono nella stretta di mano
poi si associano h2a b e h2ab
disassemblaggio-> alla replicazione gli istoni nelle figlie sono in parte di neosintesi e in parte veccchi.
- il dimero h2ah2b si dissocia
- h3 h4 scivola sul DNA
- sintesi dei nuovi
- ri assemblagigo casuale