Neurotransmisores: moléculas químicas que sirven como mensajeros para la transmisión de información entre las dos células implicadas en la sinapsis química. Pueden clasificarse como excitatorios o inhibitorios, dependiendo de su efecto en la neurona postsináptica; los neurotransmisores excitatorios, como el glutamato, aumentan la probabilidad de que la neurona postsináptica genere un potencial de acción, mientras que los neurotransmisores inhibitorios, como el ácido γ-aminobutírico (GABA), disminuyen esta probabilidad.
Para que la sinapsis funcione apropiadamente, debe haber un proceso para la terminación de la señal, de manera que la célula postsináptica pueda regresar a su estado de reposo, lista para recibir las nuevas señales. Para esto, la hendidura sináptica se limpia de neurotransmisores a través de desactivación enzimática, recaptación por medio de la neurona presináptica por endocitosis o transportadores, o simplemente por difusión.