Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Transcriptome Sequencing, ณัฐมน ส้มแก้ว
Nattamon_017_01 - Coggle Diagram
Transcriptome Sequencing
-
-
-
-
การเตรียมตัวอย่าง
- 🧬 Eukaryotic RNA
• ความเข้มข้น > 20 ng/µl
• ค่า RIN > 7
• ใช้ได้กับ Illumina, PacBio, Nanopore
- 🦠 Prokaryotic RNA
• ต้องทำ rRNA depletion ก่อน
• วิเคราะห์ gene expression และ small RNA (sRNA)
-
การประยุกต์ใช้
- วิเคราะห์การแสดงออกของยีน (Gene expression analysis)
- เปรียบเทียบยีนระหว่างเนื้อเยื่อปกติและเนื้อเยื่อที่เป็นโรค (Differential gene expression)
- วิเคราะห์ non-coding RNA เช่น miRNA, lncRNA
- • วิจัยมะเร็ง: ค้นหา biomarker และยีนที่เกี่ยวข้อง
- ค้นหา target gene สำหรับการพัฒนายา (Drug discovery)
-