Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
DIGITAL PCR (dPCR), นางสาวสายสุณี หวังสกุล 6604071630446 - Coggle Diagram
DIGITAL PCR (dPCR)
Digital PCR (dPCR) คือ ???
❤️เทคนิคการวัดปริมาณกรดนิวคลีอิก (DNA หรือ RNA) ที่มีความแม่นยำและละเอียดสูง โดยการแบ่งตัวอย่างออกเป็นปฏิกิริยาย่อยๆ จำนวนมาก (หลักพันถึงหลักแสน) จากนั้นทำการเพิ่มปริมาณและวิเคราะห์แยกกันเป็น "ดิจิทัล" เพื่อให้สามารถนับจำนวนโมเลกุลเป้าหมายได้อย่างแม่นยำโดยไม่ต้องใช้ standard curve
⭐️การนำ DIGITAL PCR ไปประยุกต์ใช้
⭐️ Genomics Research: งานวิจัยพันธุกรรมและโมเลกุล
⭐️โรคติดเชื้อ (Infectious Diseases): ตรวจเชื้อไวรัส เช่น SARS-CoV-2
⭐️Food Safety: ตรวจสิ่งปนเปื้อน/ความถูกต้องของอาหาร
⭐️การแพทย์แม่นยำ (Precision Medicine): ตรวจยีนมะเร็ง
⭐️เกษตรกรรม (Agriculture): ตรวจโรคพืช, GMO
💥ข้อดีของ DIGITAL PCR
🚩ข้อจำกัดของ DIGITAL PCR
🚩เครื่องมือและสารเคมีมีราคาสูง
🚩 วิเคราะห์ตัวอย่างได้จำกัดเมื่อเทียบกับ qPCR
🚩 ระบบซับซ้อน ต้องใช้ microfluidics/droplet
🚩 ใช้เวลามากกว่าบางเทคนิค
🚩 ความเสี่ยงต่อการปนเปื้อนและความผิดพลาด: ขั้นตอนการเตรียมตัวอย่างที่ยุ่งยากและการถ่ายโอนหลายขั้นตอน ทำให้มีความเสี่ยงต่อการปนเปื้อนข้ามหรือข้อผิดพลาดอื่นๆ
💥ความไวและความแม่นยำสูง สามารถวัดปริมาณ DNA/RNA ได้อย่างแม่นยำ โดยไม่ต้องใช้ standard curve
💥ลดต้นทุนโดยใช้ปริมาตรปฏิกิริยาที่น้อย (พิโคถึงนาโนลิตร) ทำให้สิ้นเปลืองรีเอเจนต์และตัวอย่างน้อยลง
💥ตรวจเป้าหมายที่มีปริมาณต่ำได้ดี
💥ทนต่อสารยับยั้ง PCR (PCR inhibitors)
💥 การวัดปริมาณเชิงสัมบูรณ์: ให้ผลลัพธ์เชิงปริมาณสัมบูรณ์ได้โดยไม่ต้องใช้ค่าอ้างอิง ทำให้การวัดมีความน่าเชื่อถือและลดความผันแปร
⛳️หลักการทำงานของ dPCR
⛳️การเตรียมตัวอย่าง (Sample Preparation)
⛳️การแบ่งส่วน (Partitioning)
ปฏิกิริยา PCR หรือ ตัวอย่าง DNA หรือ RNA จะถูกแบ่งออกเป็นหยดหรือปฏิกิริยาย่อยเล็กๆ จำนวนมาก ซึ่งแต่ละหยดจะมีโมเลกุลเป้าหมายเพียง 1 โมเลกุล หรือไม่มีเลย (ตรวจด้วย fluorescence)
⛳️การเทอร์โมไซเคิล (Thermal Cycling)
เพิ่มจำนวน DNA หรือ RNA เป้าหมาย โดยเครื่อง PCR จะนำตัวอย่างไปผ่านกระบวนการเทอร์โมไซเคิล โดยใช้ขั้นตอนการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอเหมือน PCR ทั่วไป (Denaturation, Annealing, Extension) เพื่อขยายสารพันธุกรรมเป้าหมายภายในแต่ละหยด
⛳️การวิเคราะห์ผล (Analysis)
หลังจากเทอร์โมไซเคิลเสร็จสิ้น แต่ละหยดจะถูกอ่านค่าฟลูออเรสเซนซ์ โดยสัญญาณฟลูออเรสเซนต์จะบ่งชี้ว่าหยดนั้น ๆ มีการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอเป้าหมาย (เป็นบวก) หรือไม่ และจะใช้สถิติ (เช่น Poisson) เพื่อช่วยคำนวณจำนวนโมเลกุลเป้าหมายในตัวอย่างเริ่มต้น ทำให้ได้ผลลัพธ์ความเข้มข้นที่แม่นยำ
เตรียม PCR mix (template + primer/probe + mastermix)
นางสาวสายสุณี หวังสกุล 6604071630446