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Chimie organique, MOLECULES ET CELLULES - Coggle Diagram
Chimie organique
Nomenclature
Groupes
Degré 0
Alcanes
Organométalliques
Degré 1 : monovalentes
Alcènes (double liaison C)
Alcools (-OH)
Amines (R-NHH)
Esters (R-C double liaison O-O-R')
Thiols (R-SH)
Halogènes (F, Cl, Br, I)
Degré 2 : bivalentes
Alcynes (C triple liaison C)
Carbonyle (C double liaison O)
Degré 3 : trivalentes
(spécifiques)
Degré 4 : tétravalentes
(un seul atome de
carbone central)
Recherche chaîne principale : -> chaîne avec la fonction principale -> le + d'atomes C -> le + de liaisons multiples -> le + de substituants -> les + petits indices de position
Priorité des groupes : halogénure > nitré > alcyne > alcène > sulfides > éthers > imines > amines > hydro peroxydes > thiols > phénol > alcool > thiocétone > cétone > thioaldéhyde > aldéhyde > nitrile > amide > halogénure d'acyle > ester > acide sulfanique > acide carboxylique > cations
Si cyclique : rajouter cyclo-X, si dérivé du benzène rajouter benz-X
Alcanes : Méthane, Ethane, Propane, Butane, Pentane, Hexane, Heptane, Octane, Nonane, Décane
Degré
d'oxydation
Réactions "classiques"
Si degré d'oxydation diminue : réduction
Si degré d'oxydation augmente : oxydation
Si degré d'oxydation ne varie pas (isophysique)
Substitution
Elimination
Addition
Représentations
Représentation de Lewis
On représente tout
Représentation perspective
Avec les traits de perspective en 3D
Représentation Newman
On se place dans l'axe du carbone, et on représente les substituants en cercle
Représentation Fischer
Molécule placée verticalement, en haut la fonction la plus oxydée
Formule développée
Formule semi-dévelopée
Formule topologique : on marque seulement les atomes autre que C et H, ou les C et H liés a ces atomes
Structure électronique du carbone C : 4 électrons de valence
Formations et destructions des liaisons
Atome cède un doublet tandis que l'autre l'accepte sur une case électronique vacante (l'atome le + électronégatif récup le doublet)
Etat fondamental : 1s²2s²2p²
Carbone sp³ : 1s²2sp³
Carbone sp² : 1s²2sp²2p
Carbone sp : 1sp² 2sp 2p²
Réactions Acido-basique
Le pKa (-log[Ka]) est le paramètre mesurant les forces des acides et des bases
Un acide est une molécule capable de céder un ion H+, et une base (parfois appelée "sel") est une molécule capable de capter cet ion H+
Chaque acide (AH) possède sa base conjuguée (A-)
pH = pKa + log[A-]/[AH]
Constante d'acidité a 25°C : Ka = [A-] (éq) x [H3O+] (éq) /[AH] équivalence
Diagramme de prédominence
Si pH < pKa, alors il y a plus de concentration d'acide que de base a l'équivalence ([A-] < [AH])
Si pH = pKa, alors il y a autant de concentration d'acide que de base a l'équivalence ([A-] = [AH])
Si pH > pKa, alors il y a moins de concentration d'acide que de base a l'équivalence ([A-] > [AH])
Cinétique chimique
Facteurs cinétiques
Solvant
Concentration
Température (phénomène émergent du mouvement des particules)
Pression
Etat physique des réactifs (plasma-gazeux-liquide-soldie)
Catalyseur
Substance chimique non consommée lors de la réaction qui accélère la dite réaction
Vitesse volumique : dérivée de la concentration molaire en un instant t
Loi de vitesse d'ordre 1 : équation différentielle [A] (t)=[A]0 x e-kt
Sens d'évolution dans une réaction aA + bB = cC + dD
Quotient de réaction : Qr = C expo c x D expo d/ A expo a x B expo b
K = Qr à l'équivalence
Si Qr < K, alors la réaction évolue des réactifs vers les produits
Si Qr > K, alors la réaction évolue des produits vers les réactifs
Si Qr = K, alors la réactionn'évolue pas
Chimie quantique
Nombres quantiques
n (niveau énergétique) : correspond à la taille de la couche électronique et au niveau énergétique de l'électron
l (nombre azimutal) : correspond à la configuration électronique de la couche (l = 0 = s / l = 1 ou -1 = p / l = 2 ou -2 = d et l = 3 ou -3 = f)
m (nombre magnétique) : correspond à l'orientation de la configuration électronique
s (spin)
MOLECULES ET CELLULES
Gradient :
L'eau va du milieu le - concentré en soluté (ions) au milieu le + concentré
Les solutés vont du milieu le + concentré en soluté au - concentré (ils se repartisent)
Structure et fonction d'une cellule UNIcellulaire
Eucaryote (eukaryota)
Possède un noyau, souvent avec une membrane. Ce noyau est très complexe. Possède également un
cytosquelette
, un squelette minéral interne a la cellule
Cellule végétale : possède une paroi pectocellulosique, EXTERNE à la cellule ainsi que des chloroplastes et une vacuole (gros organite permettant de stocker de l'eau)
Cellule animale (aussi appelée métazoaires) : ne possède pas de chloroplastes ni de paroi, et stocke son eau directement dans le cytoplasme
Procaryote (prokaryota)
Cellule simple se déplaçant avec des flagelles (sorte de queue qui ondule), des cils (petites extension de la cellule agissant comme des pattes) ou alors en se laissant porter par l'eau/l'air
Virus
Organismes pas vraiment vivants, s'introduisant dans une cellule, l'infectant et en prenant le contrôle afin de se reproduire
Structure cellulaire
Membrane plasmique : double couche de phospholipides permettant d'y encastrer certaines molécules (dîtes intramembranaires)
Hyaloplasme (ou cytosol) : suc cellulaire dans lequel baigne les organites
Cytoplasme : compartiment cellulaire qui contient l'hyaloplasme
Noyau : contient le matériel de duplication de la cellule
Enveloppe nucléaire : double membrane autour du noyau (en continuité avec le REG)
Pores nucléaires : espaces d'échange entre la cellule et le noyau
ADN (euchromatine) : ADN décondensé avec les molécules d'attachement et de condensation
ADN (hétérochromatine) : ADN légèrement condensé avec les molécules d'attachement et de condensation
ADN (chromosome) : ADN condensé
Nucléole : sous compartiment sans membranes qui sert à la production des ribosomes
Paroi pectocellulosique : matrice extra-cellulaire qui protège les cellules végétales
Lamelle moyenne : couche de lignine entre la paroi et la membrane chez les cellules végétales
Réticulums endoplasmiques
Lisse (REL) : sert à la synthèse des lipides et leur stockage, ainsi qu'au stockage du calcium
Rugueux/granuleux (REG) : possède des ribosomes en surface, sert à la synthèse et maturation des protéines
Ribosomes et polysomes (groupement de ribosomes) : permet la synthèse des protéines (traduction)
Appareil de Golgi : permet la maturation des protéines, le tri des protéines et la synthèse des protéoglycanes, ainsi que le transport des protéines
Saccule : sac de l'Appareil de Golgi permettant le transport des protéines
Vésicule : partie de l'Appareil de Golgi permettant le déplacement des saccules
Dictyosome : groupe de saccules
Mitochondrie : délimitée par une double membrane, permet la respiration (dégradation des sucres) + contribue à l'apoptose (mort programmée de la cellule)
Chloroplaste : délimité par une double membrane, permet la photosynthèse
Tonoplaste : membrane séparant la vacuole du reste de la cellule
Vacuole : "vide" dans la cellule qui permet de stocker de l'eau ou d'autres molécules