Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) - Coggle Diagram
Single Nucleotide Polymorphisms (SNP)
Disadvantages of SNPs
ถ้ามีข้อมูล SNP น้อยไปไม่สามารถใช้เป็น Marker ได้
ต้องมีข้อมูล SNP มากเพื่อให้ได้ข้อมูลเกี่ยวกับตัวอย่าง DNA ในระดับเดียวกัน
Type of SNPs
Causative SNPs
เกิดใน Gene ส่งผลกระทบต่อ protein function มีความสัมพันธ์กับโรคและมีผลต่อการตอบสนองต่อการให้ยาเฉพาะส่วนบุคคล
Non Coding region
Intron SNP(iSNP)
SNP ที่เกิดบริเวณ Intron มักทำหน้าที่เป็น Intronic enhancer
Regulatory SNP(rSNP)
SNPที่มีผลในการควบคุมการแสดงออกของยีน เกิดบริเวณ promoter สำคัญในการควบคุมการแสดงออกของยีนให้มากขึ้นหรือลดลง
Coding region
Non synonymous
การเปลี่ยนแปลงลำดับเบสแล้วทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงชนิดของ กรดอะมิโน
Nonsense
การเปลี่ยนแปลงลำดับเบสแล้วทำให้เกิด Stop Codon
Missense
การเปลี่ยนแปลงลำดับเบสแล้วทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงชนิดของ กรดอะมิโน เป็นกรดอะมิโนตัวอื่น
Synonymous
การเปลี่ยนแปลงลำดับเบสแล้ว
ไม่เกิดการเปลี่ยนแปลงของกรดอะมิโน
Linked SNPs
เกิดนอก Geneมักไม่ส่งผลกระทบต่อprotein function
คือการแปรผันของลำดับ DNA ซึ่งมีการเปลี่ยนแปลง Nucleotide 1 ตัวในจีโนม ส่งผลทำให้เกิดความแตกต่างของสิ่งมีชีวิต ดังนี้
เกิดความแตกต่างในลักษณะ Phenotype เช่น สีผิว ส่วนสูง สีตา
เกิดความแตกต่างในปัจจัยเสี่ยงที่ทำให้เกิดโรคทางพันธุกรรม
เกิดความแตกต่างต่อการตอบสนองต่อการให้ยา
Advantages of SNPs
สามารถใช้ SNP ตรวจดูว่าผู้ป่วยมีปัจจัยเสี่ยงที่จะเกิดโรคทางพันธุกรรมมากน้อยเพียงใด ก็จะสามารถหาทางป้องกันได้
ถ้ามีข้อมูล SNPที่มากพอจะสามารถโชว์อัตราการเกิด Mutation ได้
มีประโยชน์ต่อการศึกษาความผิดปกติทางพันธุกรรม
เป็นเครื่องหมายโมเลกุลที่พบมากในมนุษย์ที่ใช้ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรม
SNPs Applications
ช่วยบ่งชี้หน้าที่ยีนอันเป็นผลมาจาก SNP
ช่วยทำนายการตอบสนองต่อการใช้ยา
ช่วยในการวินิจฉัยโรคหรือดูปัจจัยเสี่ยงในการเกิดโรค