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Microbiota e tecniche di microbiologia - Coggle Diagram
Microbiota e tecniche di microbiologia
INTRODUZIONE
Hanno rapporto di simbiosi con l'ospite, in continua evoluzione in quanto va incontro alle condizioni dell'ospite.
Ha azione benevola sul SI, favorisce l'integrità della barriera intestinale e le sue funzioni metaboliche; viene definito secondo cervello in quanto ha comunicazione bidirezionale con il SNC, l'autonomo con pathways diretti e indiretti
I vari tipi di comunicazione sono
nervo vago
SI
sistema circolatorio
segnalazione neuroendocrina
permeabilità intestinale alterata
Si dividono in vari consorzi a seconda del distretto
cute
naso (acquisiti respirando)
apparato respiratorio
bocca (lingua e denti)
tratto genitourinario
tratto gastrointestinale (flora digestiva)
L'intestino crasso presenta la più grande popolazione di batteri, aerobi e anaerobi; è già presente alla nascita e subisce modificazioni (x allattamento, tipo di parto, dieta, malattie, dieta, ecc.)
Vengono tollerate dal nostro SI, grazie a specifici pattern molecolari; ho adesione e grazie alle batteriocine prevengono l'adesione di altri batteri patogeni
DISBIOSI
Ho alterazioni del microbiota dati da diversi fattori, tipo
fattori genetici
traslocazione microbiota
infiammazione cronica
produzione di citochine infiammatorie
sindrome intestino gocciolante
uso di antibiotici
La sindrome dell'intestino gocciolante è un'interruzione dell'integrità della barriera epiteliale dell'intestino, con traslocazione dei batteri nella mucosa dando infiammazione cronica
Le patologie della mucosa intestinale e non creano disbiosi
cancro colon-retto
sindromi mal assorbimento
infiammazioni intestinali croniche
diarree
obesità
cirrosi epatiche
malattie cardiovascolari
L'equilibrio perfetto (eubiosi) è dato da diversi fattori come
fattori esterni
proprietà dell'ospite
Vado a vedere se ho eubiosi o disbiosi grazie all'analisi del microbioma intestinale, che valuta i 16S rRNA.
Il trapianto fecale è utilizzato come ultima risorsa quando la terapia antibiotica non funziona
Ho vari sintomi
aerofagia
crampi addominali
allergie
alito cattivo
diarrea
Ho sia i prebiotici, ingredienti alimentari (fibre naturali) non digeribili che stimolano la crescita e attività metabolica dei batteri, sia i probiotici, microrganismi vivi che quando consumati promuovono la sopravvivenza degli altri (presenti nello yogurt)
TECNICHE DI MICROBIOLOGIA
Servono per individuare un determinato agente eziologico in un campione biologico. Una volta raccolto dal tessuto o campione più adatto subirò colorazione e isolamento sul terreno di coltura, procedendo con l'antibiogramma per capire gli antibiotici da utilizzare
L'antibiogramma studia la sensibilità agli antibiotici; misura la MIC, la minima concentrazione inibente in un range di diluizioni di un antibiotico che inibisce la crescita dei batteri; più la MIC è bassa, più l'antibiotico è efficace
L'esame a microscopio può essere condotto con vari tipi di microscopi
in campo chiaro
in campo scuro
a contrasto di fase
fluorescenza
elettronica
Ho la colorazione su campioni fissati (sia con calore che chimicamente); sono
semplice (un solo colorante)
differenziate (informazioni su morfologia e disposizione)
speciali, per informazioni aggiuntive
Di solito si fa doppia colorazione
1) fissazione con mordenzante
2) decoloro con alcool
3) secondo colorante
nei gram più ho il primo colorante, nei gram - l'alcol degraderà il LPS e avrò il primo colore
Le colorazioni speciali sono
inchiostro di china (per evidenziare capsula)
colorazione spore (verde di malachite)
colorazione dei flagelli (sali di acido tannico)
I batteri hanno bisogno di terreni fertili con sostanze nutritive per crescere; o abbiamo terreni liquidi o semi-solidi, come l'agar.
A seconda dello stato chimico i terreni di coltura si differenziano in
terreni a composizione chimicamente definita (per batteri con particolari esigenze nutrizionali)
terreni a composizione chimica non definita
terreni minimi, con ioni
terreni di arricchimento, con sangue, siero per microrganismi esigenti a livello nutritivo
In base alla tipologia di informazioni ho
terreni non selettivi, per la crescita di molte specie
terreni selettivi, per alcune specie
terreni elettivi, favoriscono delle specie senza inibire le altre
terreni differenziali, per la differenziazione di specie sulle loro caratteristiche biochimiche
I terreni selettivi contengono antibiotici con attività battericida, per eliminare i contaminanti.
Sono
MacConkey agar, che inibiscono la crescita dei gram più
Mannitol salt agar, con elevato NaCl
SS agar, per la salmonella
Ho terreni per batteri emolitici, svolta su agar-sangue o agar-cioccolato. Si creano così tre tipi di emolisi
α emolisi, dà alone verde per la degradazione di bilirubina e biliverdina
β forma un alone trasparente intorno alla colonia
γ mancanza di emolisi
Ho prove della virulenza di alcuni batteri come
catalasi
ossidasi