El Canal de Jambelí, ubicado al sureste de la isla de Puná, es una vía de navegación que presenta ciertos peligros debido a la presencia de bancos de arena que cambian de posición con el tiempo. Entre ellos, destaca el temido Banco de Mala, que obliga a los barcos de gran calado a emplear prácticos para su navegación segura. Hacia el noroeste de Puná, el Canal del Morro es otro estrecho importante, con 7 apenas una milla náutica de ancho en su punto más angosto, entre Punta Trinchera y Punta Arena del Morro. La navegación en esta zona es riesgosadebido a los arrecifes conocidos como Farallones, por lo que los buques de mayor tamaño evitan esta ruta. El Estero Salado, que conecta directamente con el golfo, permite que las aguas marinas lleguen hasta Guayaquil. Su anchura inicial es de tres millas náuticas, pero se va estrechando conforme avanza hacia la ciudad. Este canal es lo suficientemente profundo y seguro para la entrada de grandes embarcaciones hasta las cercanías de los Baños del Salado, en Guayaquil.
-