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Genoma minimo, Regolazione genica negli eucarioti, Trasmissione…
Genoma minimo
Insieme di geni essenziali
identificare i geni minimi per la sopravvivenza
Craig venter
Cellula sintetica
473 geni
sotto muore
inattiva i geni con le mutazioni
Mycroplasma genitalium
Capire a cosa serve ogni gene
Regolato
attivi solo se necessari
Teoria dell'operone (procarioti)
Inducibile (indurre vuol dire attivare)
lac = lattosio
1) gene regolatore riconosce che è necessario attivare il lac
2) il lattosio si inserisce sul repressore e fa passare la RNA Polimerasi (induttore)
3) RNA polimerasi trascrive i geni del lac (strutturali)
4) il lattosio viene usato come fonte di energia
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cambia forma
reprimibile = deve essere bloccato sennò è sempre attivo
trp = triptofano
triptofano = amminoacido
1) gene regolatore riconosce che c'è troppo triptofano
2) il triptofano si unisce al repressore facendolo "incastrare" sul DNA
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Costitutivo o housekeeper
Non può essere spento
Regolazione genica negli eucarioti
perché sono diversi dai procarioti
cromosomi linear
organuli cellulari
pluricellulari
possono dover produrre sostanze specializzate nelle diverse cellule
più proteine che devono essere sintetizzate
splicing alternativo
splicing
maturare l'm-RNA
1) trascrizione di un pre-m-RNA
introni + esoni
introni si tagliano via
esoni si uniscono per fare l'm-RNA
2) splicing
normale
taglio via gli introni e unisco gli esoni
formo una proteina principale
alternativo
tengo parte o la totalità degli introni
formo una seconda proteina che è più rara da formare
3) capping
proteggere l'informazione
farlo uscire dal nucleo poroso della cellula
riconosciuto come m-RNA
spliceosoma
complesso proteico (insieme di proteine)
modulazione del processo
posso velocizzare o rallentare la produzione di proteine
spiralizzazione della cromatina maggiore
eucromatina
meno densa
posso usarla per trascrivere
eterocromatina
più densa
no trascrizione
tre tipi RNA polimerasi
t-RNA
m-RNA
r-RNA
m-RNA ha svolto la sua funzione
diventa inutile o dannoso
small RNA
mi-RNA
Si attaccano al m-RNA e lo "tappano"
non si può più legare ai ribosonmi
ubiquitina
proteina
proteasomi
RNA interferenti
eucarioti
quali geni devo spegnere o accendere?
fattore di trascrizione
unisce i codoni per avvicinarli
enhancer
silenzia i codoni in modo che la RNA polimerasi non li trascriva
silencer
Virus
entità biologiche
Formate da
Acido nucleico
DNA
RNA
Retrovirus
trascrizione inversa
da RNA a DNA
Capside proteico
può avere sopra le glicoproteine
membrana plasmatica
glucosio + proteine
fanno riconoscere il virus come organismo amico
cicli infettivi
ciclo litico
riprodursi più velocemente possibile
danneggia la cellula ospite immediatamente
taglia il DNA della cellula ospite e produce il suo DNA e le proteine per la capsula
trasduzione generalizzata
ciclo lisogeno
Si unisce al cromosoma
durante la scissione binaria o la mitosi (negli eucarioti) la cellula riproduce anche DNA virale
favorita la trasduzione
trasduzione specializzata
Trasmissione informazioni nei procarioti
no riproduzione sessuata
sono geneticamente dei cloni
mutino molto lentamente solo per fattori casuali ambientali
metodi che aumentano variabilità genetica
interni all'organismo
il trasposone
esterni all'organismo
coniugazione
deve avere il plasmide
ha i geni per formare il pilo sessuale
trasformazione
prende pezzi de DNA dall'ambiente esterno
vedi esperimento di Griffith
trasduzione
i virus infettando i batteri, si portano dietro un pezzettino di DNA dell'ospite precedente