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Examens biologiques - Coggle Diagram

- - - - Ponction lombaire avec médecin, avant ATBthérapie (sauf si purpura fulminans)
        5 tubes minimum de 10-20 gouttes : bactériologie, mycobactéries ou PCR, biochimie, virologie, anapath, 1 tube de réserve au réfrigérateur
    - - Examens spéciaux en cas de méningite
        Antigènes solubles dans LCS pneumocoques
        PCR méningocoques ou pneumocoques LCS et sang
  - - - 2 paires (3 si suspicion d'endocardite)
        
        urgence thérapeutique : 2 paires espacées de quelques minutes ou prélèvement unique
        
        fièvre continue : 2 paies espacées d'au moins 30 min
        
        fièvre discontinue : 2 paires aux pics fébriles > 38,5°C
        
        hypothermie (entérobactérie)
        Conditions : ponction veineuse, flacon aérobie puis anaérobie 10mL/flacon
        Flacons pédiatriques (aérobie) à remplir selon poids du patient
        Incubation 5 j (ou max 28j si suspicion d'endocardite)
    - - Champignons, levures
        infection du cathéter ou patient immunodéprimé
        1 flacon aérobie, incubation 15j
        
        Mycobactérie
        tube et automate spéciaux
  - - - Lavage antiseptique puis rinçage de bouche
        effort de toux
        cytologie > 25 PNN et < 25 cellules épithéliales /champs
        culture > 10x7/mL
    - - Fibroscopie bronchique
        injection sérum phy et aspiration
        mise en culture
        culture > 10x4/mL
    - - Recherche du bacille de Koch (BK)
        
        Bactériologie
        bactérie aérobie stricte, à croissance lente
        coloration de Ziehl-Neelsen (fushine)
        examen direct : bacilles acido-alcoolo-résistants
        
        Prélèvements respiratoires
        crachats : 2-3 prélèvements, 2-3 j consécutifs, sur expectoration matinale
        tubage : au réveil à jeun avant lever
        expectorations induites
        fibroscopie bronchique si examens précédents négatifs
      - Examens spéciaux sanguins
        IGRA (tests immuno)
        Quantiféron : prélèvements sanguins sur tubes spéciaux
        TB-spot si immunodépression
  - - - 1 seul prélèvement, à conserver à 4°C
        examen direct de recherche de leucocytes
        mise en culture pour bactériologie
        PCR multiplexe
    - - 1 prélèvement par jour pendant 3j
        examen direct de recherche de parasites, d'oeufs
        éventuelle mise en culture
        PCR multiplexe
  - - - Interprétation
        selon contexte clinique
        
        leucocyturie : seuil 10x4/mL
        
        bactériurie
        ECBU contaminé si présence de 2 espèces bactériennes différentes ou plus
        
        seuils de significativité
        E. coli, S. saprophyticus : 10x3/mL H etF
        autres bactéries : 10x3/mL H ; 10x4 mL F
    - - 1ère miction du matin
        urines du 1er jet pour récupérer les bactéries du canal urétral
        PCR
    - - Conditions de prélèvement
        
        1ère miction du matin
        
        lavage des mains
        
        toilette de la zone vulvaire ou du méat urinaire au Dakin
        
        recueil des urines du 2ème jet (évite contamination par bactéries de la flore commensale)
        
        conservation à 4°C