Lo dicho hasta ahora sugiere que los anticuerpos se diferencian entre si en el sitio de unión al antígeno, siendo el resto del anticuerpo igual de unos anticuerpos a otros. En realidad, la cosa es un poco más compleja, ya que hay diferencias en la zona supuestamente igual. Según las diferencias de composición encontradas en la zona común, se han descrito cinco clases de anticuerpos (IgM, IgG, IgA, IgD, IgE) y, dentro de cada clase, se han descrito varias subclases (ej. IgG1, IgG2, IgG3, IgG4). En todos los casos, Ig indica Inmunoglobulina, ya que los anticuerpos pertenecen al grupo de proteínas llamado gamma-globulinas o inmunoglobulinas.