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核心问题:样本的免疫逃逸程度是否差异?如何区分出不同逃逸程度的样本, :fire:, 理解三者关系,是为了帮助推出什么样的情况下样本更倾向逃逸,但是…
核心问题:样本的免疫逃逸程度是否差异?如何区分出不同逃逸程度的样本
可以运用这些逃逸指标来找到不同逃逸程度的样本吗?(
设计一个逃逸程度的综合划分方法)
不同逃逸指标间有什么关系?(是不是会互斥or共发生)
逃逸指标是否真的能反映逃逸程度?
逃逸指标的发生是否需要条件?肿瘤逃逸受哪些因素的影响
要在什么条件下,发生哪些逃逸指标,才可能反映肿瘤逃逸呢?
突变率是否与肿瘤逃逸有关?
是不是突变率越高,各种逃逸指标下的样本比例都越大?或者逃逸指标越强? :star:
高、低浸润样本中,发生逃逸指标的样本,是否亚克隆新抗原数目更高?
为什么高TMB肿瘤,转录组与基因组指标会出现相关?
有一些driver基因和基因组逃逸指标的发生相关,这能反映什么??
免疫浸润是否与逃逸相关?(高浸润导致逃逸样本越大?)
毒性杀伤细胞浸润越强,是否各类逃逸指标都更强?或者发生逃逸指标的样本更多?
其他细胞浸润是否也与逃逸指标的发生有关?
免疫浸润是否与亚克隆新抗原数目相关?
免疫浸润越强,是否亚克隆新抗原数目越大?
可以主要看看在转录组指标中的变化;为什么不是TMB越大,浸润越多,逃逸越多??
逃逸指标是否能反映亚克隆新抗原变化?
每种逃逸指标下,发生了这种逃逸指标的样本,是否亚克隆突变中的新抗原比例升高?【可以看,是否能通过这个逃逸指标,发现未逃逸肿瘤中存在的负向选择情况?侧面反映该逃逸指标是否有用?】
在高、低TMB的样本下,分别去看亚克隆突变中的新抗原比例【针对每种逃逸指标】【想反映是否在高or低TMB下,这种逃逸指标更可能看出其是否真的具有逃逸的效用??】
每种逃逸指标下,是不是发生了逃逸指标的样本,其亚克隆新抗原数目越大?
gene88mut不同频数下的结果?
负向选择与免疫逃逸指标???
基因组逃逸指标是否正向选择?
哪些逃逸指标可以表征逃逸?
样本中不同逃逸指标的发生情况?
:fire:
理解三者关系,是为了帮助推出什么样的情况下样本更倾向逃逸,但是它要怎么才可以帮助我们找出不同逃逸样本呢,要怎么运用它?