Las neuronas proveen la única fuente de serotonina en el SNC, cuyo precursor es el triptofano, por lo que la disponibilidad de este es un factor limitante en la síntesis de serotonina; el área más importante donde existen neuronas serotoninérgicas son los núcleos del rafe; el núcleo posterior (dorsal) y medial tienen proyecciones hacia diversas regiones cerebrales incluyendo corteza, hipocampo, estructuras límbicas, estriado, tálamo, mesencéfalo e hipotálamo.
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