PROTEINE INTRINSECAMENTE DISORDINATE

si tratta di proteine che presentano assenza di una struttura stabile

DEFINIZIONE

le funzioni sono:

  • trasduzione del segnale
    → sono implicata nella costituzione di complessi di attivazione recettoriale
  • trascrizione di mRNA
  • interattori
    → guidano l'associazione tra proteine e acidi nucleici
  • chaperons molecolari
    → guidano la riacquisizione di un corretto folding

l'ordine molecolare si associa ad una specificità di azione

ORDINE MOLECOLARE

aumento delle
POSSIBILITA' FUNZIONALI


il disordine molecolare

  1. correla con una più ampia gamma di azioni svolte
  2. conferisce una magg possibilità di azione

questo dipende da:

  • num di aa idrofilici
    → maggiore è il num di aa idrofilici e magg è la tendenza al disordine
    1. il ripiegamento proteico infatti è guidato dall'idrofobicità degli aa
    2. che li spinge a occupare regioni interne
  • complessità di sequenza
    → la quale è correlata all'eterogeneità della comp aa
    1. se la complessità è bassa
    2. allora la comp amminoacidica NON è eterogenea, ovvero ci sono frequenti ripetizioni di aa

DISORDINE MOLECOLARE

FUNZIONE

CLASSIFICAZIONE

ENTROPIC CHAINS


presenta:

  • max disordine molecolare
  • max entropia
  1. a seconda delle interazioni instaurate
  2. variano la loro conformazione

EFFETTORS


  • definizione
    → proteine che contegono elementi di disordine e che svolgono funzione regolative della proliferazione cellulare:
    • inibitori delle CDK

SCAVENGERS


implicate in:

  • smaltimento di ROS
    → a livello epatico
  • detossificazione epatica

ASSEMBLERS


guidano l'assemblaggio di complessi molecolari, ad esempio il ribosoma

DISPLAY SITES


mediano le modifiche post-traduzionali

INTERATTOMICA

disciplina che studia le interazioni molecolari tra proteine in un organismo vivente mediante tecniche sperimentali e computazionali

DEFINIZIONE

è l'insieme di interazioni tra le proteine di un sistema

AGGRESOMA

  1. aggregazione di proteine ripiegate in modo errato all'interno della cellula
  2. che si forma quando il num di proteine misfolded supera la fisiologica capacità del sistema di degradazione delle proteine


  3. l'aggresoma è un processo altamente regolato dalla cellula

  4. una modalità con la quale la cellula organizza le proteine mal ripiegate in un unico locus

gli aggresomi possono essere sia positivi che negativi per la cell

- CITOPROTETTIVI

  1. nel caso in cui la loro presenza velocizzi lo smaltimento di proteine tossiche

- CITOTOSSICI

  1. nel caso in cui invece un loro accumulo scatena malattia neurodegenerative

INTERATTOMA

DEFINIZIONE

MORBO di PARKINSON

⍺-SINUCLEINA

è una proteina coinvolta in diversi disordini neurodegenerativi in grado di legare partners diversi in differenti modi

presenta regioni disordine molecolare, il quale aumenta le possibilità funzionali della proteina

  1. l'interazione dell'⍺-sinucleina con partner di legame
  2. induce una transizione disordine → ordine

le principali funzioni svolte sono:

  • impacchetamento nelle vescicole

MUTAZIONI

  1. mutazioni a carico dell'
    ⍺-sinucleina comportano l'aggregazione anomala di aggregati amorfi
  2. detti corpi di Lewy

SINUCLEOPATIE

Morbo di Parkinson

gli aggresomi sono tossici per vari motivi:

  • alterazione membr mitocondriale
    1. alcune forme mutate sono in grado di legare la membrana mitocondriale, legandosi a TOM20
    2. determinando un legame tossico per il mitocondrio
  • perdita del potenziale transmembrana
    1. altre mutazioni possono causare la perdita del gradiente protonico a cavallo delle membr mitocondriali

TOSSICITA'

CORPI di LEWY

FUNZIONI

PARKINA

è un'altra proteina la cui mutazione favorisce l'insorgenza di Parkinson

mutazione → accumulo ⍺-sinucleina


PARK-2 è una ligasi

  1. mutazione a carico del gene PARK-2
  2. mancata azione della proteina da esso codificata ovvero la parkina
    = la quale è una ubiquitina-ligasi dell'⍺-sinucleina
  3. quindi in mancanza dell'attività ligasica
  4. l'⍺-sinucleina NON si associa al proteasoma
  5. quindi NON viene degradata
  6. e si accumula

PARK-2

mutazione → insorgenza Parkinson


PARK-5 è una ubiquitina-idrolasi

  1. PARK-5 codifica per la proteina responsabile del ripristino di mono-ubiquitina a partire da una catena poli-ubiquitinata
  2. fondamentale per il ripristino dell'attività proteasomica

PARK-5

DEFINIZIONE