PROTEINE INTRINSECAMENTE DISORDINATE
si tratta di proteine che presentano assenza di una struttura stabile
DEFINIZIONE
le funzioni sono:
- trasduzione del segnale
→ sono implicata nella costituzione di complessi di attivazione recettoriale - trascrizione di mRNA
- interattori
→ guidano l'associazione tra proteine e acidi nucleici - chaperons molecolari
→ guidano la riacquisizione di un corretto folding
l'ordine molecolare si associa ad una specificità di azione
ORDINE MOLECOLARE
aumento delle
POSSIBILITA' FUNZIONALI
il disordine molecolare
- correla con una più ampia gamma di azioni svolte
- conferisce una magg possibilità di azione
questo dipende da:
- num di aa idrofilici
→ maggiore è il num di aa idrofilici e magg è la tendenza al disordine- il ripiegamento proteico infatti è guidato dall'idrofobicità degli aa
- che li spinge a occupare regioni interne
- complessità di sequenza
→ la quale è correlata all'eterogeneità della comp aa- se la complessità è bassa
- allora la comp amminoacidica NON è eterogenea, ovvero ci sono frequenti ripetizioni di aa
DISORDINE MOLECOLARE
FUNZIONE
CLASSIFICAZIONE
ENTROPIC CHAINS
presenta:
- max disordine molecolare
- max entropia
- a seconda delle interazioni instaurate
- variano la loro conformazione
EFFETTORS
- definizione
→ proteine che contegono elementi di disordine e che svolgono funzione regolative della proliferazione cellulare:- inibitori delle CDK
SCAVENGERS
implicate in:
- smaltimento di ROS
→ a livello epatico - detossificazione epatica
ASSEMBLERS
guidano l'assemblaggio di complessi molecolari, ad esempio il ribosoma
DISPLAY SITES
mediano le modifiche post-traduzionali
INTERATTOMICA
disciplina che studia le interazioni molecolari tra proteine in un organismo vivente mediante tecniche sperimentali e computazionali
DEFINIZIONE
è l'insieme di interazioni tra le proteine di un sistema
AGGRESOMA
- aggregazione di proteine ripiegate in modo errato all'interno della cellula
che si forma quando il num di proteine misfolded supera la fisiologica capacità del sistema di degradazione delle proteine
l'aggresoma è un processo altamente regolato dalla cellula
- una modalità con la quale la cellula organizza le proteine mal ripiegate in un unico locus
gli aggresomi possono essere sia positivi che negativi per la cell
- CITOPROTETTIVI
- nel caso in cui la loro presenza velocizzi lo smaltimento di proteine tossiche
- CITOTOSSICI
- nel caso in cui invece un loro accumulo scatena malattia neurodegenerative
INTERATTOMA
DEFINIZIONE
MORBO di PARKINSON
⍺-SINUCLEINA
è una proteina coinvolta in diversi disordini neurodegenerativi in grado di legare partners diversi in differenti modi
presenta regioni disordine molecolare, il quale aumenta le possibilità funzionali della proteina
- l'interazione dell'⍺-sinucleina con partner di legame
- induce una transizione disordine → ordine
le principali funzioni svolte sono:
- impacchetamento nelle vescicole
MUTAZIONI
- mutazioni a carico dell'
⍺-sinucleina comportano l'aggregazione anomala di aggregati amorfi - detti corpi di Lewy
SINUCLEOPATIE
Morbo di Parkinson
gli aggresomi sono tossici per vari motivi:
- alterazione membr mitocondriale
- alcune forme mutate sono in grado di legare la membrana mitocondriale, legandosi a TOM20
- determinando un legame tossico per il mitocondrio
- perdita del potenziale transmembrana
- altre mutazioni possono causare la perdita del gradiente protonico a cavallo delle membr mitocondriali
- altre mutazioni possono causare la perdita del gradiente protonico a cavallo delle membr mitocondriali
TOSSICITA'
CORPI di LEWY
FUNZIONI
PARKINA
è un'altra proteina la cui mutazione favorisce l'insorgenza di Parkinson
mutazione → accumulo ⍺-sinucleina
PARK-2 è una ligasi
- mutazione a carico del gene PARK-2
- mancata azione della proteina da esso codificata ovvero la parkina
= la quale è una ubiquitina-ligasi dell'⍺-sinucleina - quindi in mancanza dell'attività ligasica
- l'⍺-sinucleina NON si associa al proteasoma
- quindi NON viene degradata
- e si accumula
PARK-2
mutazione → insorgenza Parkinson
PARK-5 è una ubiquitina-idrolasi
- PARK-5 codifica per la proteina responsabile del ripristino di mono-ubiquitina a partire da una catena poli-ubiquitinata
- fondamentale per il ripristino dell'attività proteasomica
PARK-5
DEFINIZIONE