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LA TRASCRIZIONE NEI PROCARIOTI - Coggle Diagram
LA TRASCRIZIONE NEI PROCARIOTI
è un processo molto breve che avviene nel citoplasma
dura pochi secondi ed avviene quasi contemporaneamente alla traduzione
appena il filamento di DNA viene trascritto ad RNA questo verrà subito tradotto nel corrispondente polipeptide
un gene può essere trascritto da entrambi i filamenti, a seconda di quale viene scelto come stampo
l'altro non sarà trascritto
parte da un segmento di DNA chiamato
promotore
precede il sito d'inizio della trascrizione
per convenzione si indica con +1 il
sito d'inizio
, ovvero il nucleotide che segna l'inizio dell'unità trascrizionale
possiede due
sequenze consenso
, ovvero le sequenze di basi più importanti dell'intero promotore
poiché sono riconosciute dall'RNA polimerasi per legarsi e dare avvio alla denaturazione del DNA
sequenza -10
situata 10 nucleotidi indietro rispetto al sito di inizio
entrambe le sequenze sono composte da 6 nucleotidi
sequenza -35
situata 35 nucleotidi indietro rispetto al sito di inizio
necessita di un enzima chiamato
RNA polimerasi
nei batteri esiste solo un tipo, formato da due subunità, una alfa e una beta
si può legare al promotore solamente grazie al
fattore sigma
RNApol + fattore sigma formano l'
oloenzima
che è la struttura necessaria per legarsi al promotore
una volta effettuato l'aggancio il fattore sigma si stacca, lasciando il
core
formato dall'RNApol che scorrerà fino al sito di inizio dando via alla trascrizione
indipendentemente dal filamento scelto scorrerà sempre dall'estremità 3' a 5', sintetizzando una molecola di RNA complementare da 5' a 3'
lo scorrimento è reso possibile dalla subunità alfa
è un fattore proteico che interagisce con le sequenze consenso del promotore
esistono diversi tipi di fattore sigma a seconda del loro peso molecolare
gran parte dei geni nei procarioti codificano per fattori coinvolti nel metabolismo cellulare, o utili alla sopravvivenza
fattore sigma 32
fa da tramite alla RNApol per la trascrizione di geni codificanti la sintesi delle
Heat Shock Proteins (HSP)
sono proteine da shock termico legate alla resistenza a temperature estreme
fattore sigma 54
geni per la sintesi di prodotti coinvolti nella fissazione dell'azoto
ha tre funzioni principali
induce la denaturazione dei due frammenti di DNA
definisce quale è il filamento stampo e la direzione di trascrizione, riconoscendo le sequenze consenso
induce l'interazione tra filamento stampo e RNApol
si divide in tre fasi
fase di inizio
formazione dell'oloenzima e inizio della trascrizione
fase di allungamento
l'RNApol scorre lungo l'unità di trascrizione e si forma una regione ibrida di DNA ed RNA (molto piccola=17-18 nucleotidi)
in ogni momento l'RNApol interagirà con 35 nucleotidi di DNA per colta tra regione ibrida e regione srotolata
man mano che la l'RNApol scorre aggiungendo ribonucleotidi la doppia elica si srotola da un estremo e si riavvolge a quello opposto
fase di terminazione
consiste nella trascrizione della sequenza finale dell'unità di trascrizione detta
terminatore
è una sequenza palindromica, ovvero una regione di DNA costituita da due successioni di basi ripetute e invertite
poiché queste sequenze trascritte ad RNA saranno complementari e vicine tra loro formeranno una struttura a forcina
questa sequenza rallenta la sintesi di RNA che si arresterà completamente in modi differenti a seconda che ci troviamo con una sequenza
rho dipendente
in presenza del
fattore rho
, una particolare
elicasi
che scorre sul filamento di RNA nascente fino a raggiungere la sequenza di terminazione
la sequenza di terminazione è situata subito dopo la forcella di replicazione
non essendoci residuo di uracile interviene l'elicasi a determinare il distacco tra RNA e filamento stampo
rho indipendente
la sequenza palindromica è seguita da una successione di nucleotidi contenenti adenina
viene trascritta formando un residuo di basi di uracile nel RNA complementare
il residuo determina l'interruzione della trascrizione e il distacco effettivo dalla molecola di RNA appena trascritta