Incluyen propiedades suelo-planta, la calidad del agua, la capacidad que afectan las relaciones amortiguadora del suelo y la disponibilidad de amortiguadora del suelo y la disponibilidad de agua y nutrientes para plantas y microorganismos.
Dentro de las propiedades químicas que más han sido empleadas como indicadores se destacan el pH, la conductividad eléctrica, el contenido de materia orgánica, la capacidad de intercambio catiónico (CIC) y los nutrientes (N total, nitratos,amonio, relación C:N, fósforo total y disponible, ypotasio).