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Transcripción, regulación de la transcripción y epigenética, Nutrigenómica…

- - - - El promotor actúa como una señal para indicarle a la RNA polimerasa dónde iniciar la transcripción.
    - - Creación de la burbuja de transcripción → permite que la RNA polimerasa acceda a una de las hebras de DNA.
  - - - Ocurre en una secuencia consenso.
  - - - Encapuchamiento 5´: consiste en la adición de una estructura protectora en el extremo 5' del pre-RNAm.
        
        Dicha modificación protege el ARNm, facilita su transporte (núcleo a citoplasma) y desempeña un papel importante en la regulación de la traducción.
      - Terminación poli A: Consiste en la adición de una cola de adenina (A) en el extremo 3' del ARN. Esta cola de poli A generalmente consta de cientos de nucleótidos de adenina en tándem.
        
        Es importante para la estabilidad del ARN mensajero y su transporte desde el núcleo hacia el citoplasma.
      - Splicing: Implica la eliminación de intrones (secuencias no codificantes) y la unión de exones (secuencias codificantes) para formar un RNAm maduro.
        
        Se lleva a cabo en el núcleo celular y es realizado por una maquinaria compleja llamada spliceosoma.
        
        Splicing alternativo: da como resultado la producción de múltiples isoformas o variantes de un gen a partir del mismo pre-ARNm.
- - - - Existen distintos tipos de dominios a unión a DNA como el dedo de zinc, zipper de leucinas, hélice-giro-hélice, etc.
      - Factores de Transcripción Receptores Nucleares
        
        Se dividen en:
        • Endocrinos (responden a señales hormonales específicas)
        • Huérfanos (activación desconocida)
        • Huérfanos adoptados (activación ahora conocida).
  - - - Activador, represor, coactivador, correpresor y RNAs no codificantes.
    - - Promotor, enhancer, insulator, silencers, splicing y poliadenilación.
  - - - ChREBP: regulación de genes relacionados con la glucólisis y el metabolismo de los carbohidratos. Se activa con niveles de glucosa elevados.
    - - Su activación depende de la dieta. Componentes dietéticos activan factores nucleares.
    - - La activación de NF-kB ocurre cuando IkB es fosforilada o degradada (proteólisis), lo que permite que NF-kB entre al núcleo y active la transcripción de genes necesarios para responder a estímulos como la infección o la inflamación.
      - TLR4 reconoce los LPS asociados a patógenos y desencadena una cascada de señalización que lleva a la activación de NF-kB.
    - - Isoformas:
        SREBP-1a: síntesis global de lípidos y crecimiento celular.
        SREBP-1c: síntesis de ácidos grasos y el almacenamiento de energía.
        SREBP-2: regulación del colesterol.
      - Cuando se activa se libera de la membrana del retículo endoplásmico y puede ingresar al núcleo celular.
      - Dominios clave: hélice-bucle-hélice y zipper de leucina → le permiten unirse al ADN en los elementos reguladores de esteroles.
      - Para que SREBP se active, necesita sufrir modificaciones postraduccionales, como la escisión proteolítica.
    - - Tiene dos dominios de unión al ADN: hélice-bucle-hélice y zipper de leucina.
      - Son codificados por el gen MLXIP.
      - Dos isoformas principales: ChREBPα (más común) y ChREBPβ (menos común).
      - Se activa en respuesta a una ingesta alta de glucosa. Cuando los niveles de glucosa aumentan en el citosol de la célula, ChREBP se fosforila.
    - - Los microRNA (miRNA) tienen sus genes en el genoma de la célula, mientras que los RNA de interferencia (RNAi) no tienen un gen específico en el genoma.
      - miRNA son producidos en el núcleo de la célula, se procesa por una enzima llamada Dicer.
      - Cuando se unen al RNAm, pueden causar la degradación del mismo o inhibir su traducción en proteína.
  - - - Gen puede tener varios promotores ubicados en diferentes regiones del genoma → permitiendo la producción de diferentes variantes de RNAm a partir del mismo gen.
      - Distintas variantes de mRNA → codifican proteínas con funciones y propiedades distintas.
      - Permite que un gen se exprese en diferentes tejidos o en momentos específicos del desarrollo.
      - Los genes pueden tener promotores al inicio o final.
    - - Proceso que contribuye a la diversidad de proteínas en los organismos.
      - Permite que un solo gen genere múltiples isoformas de proteínas → con sus propias funciones y características.
      - Aproximadamente el 74% de los genes humanos experimentan algún nivel de splicing alternativo.
    - - Un gen puede tener varios sitios alternativos de poliadenilación ubicados en la región 3' del ARN pre-mensajero.
      - Cada sitio de poliadenilación alternativo genera una variante de ARNm.
      - Diferentes variantes de ARNm pueden generar proteínas con propiedades y funciones distintas
    - - Enhancer: segmentos de DNA que aumentan o potencian la actividad de un gen específico. Pueden estar ubicados en lugares cercanos o más lejanos al gen que regulan, ya sea río arriba o río abajo.
      - Insulator: son como "barreras" en el ADN que detienen o aíslan la influencia de otros elementos reguladores. Impiden que las señales de activación o represión de la transcripción de un gen se extiendan a genes vecinos.
      - Silenciador: son como "apagadores" en el ADN que reducen o reprimen la actividad de un gen. Pueden estar ubicados dentro de enhancers o actuar por separado.
- - - - Facilita la transcripción.
    - - Inhibe la transcripción.
  - - - Expresión de un solo alelo, el heredado del padre. Es un ejemplo de impronta materna.
      - Este proceso de impronta no ocurre en todos los cromosomas.
    - - Solo se expresa el alelo desmetilado heredado del padre. Está implicado en la diabetes neonatal transitoria tipo 1 (TNDM1).
    - - Hay una alteración en la expresión de ciertos genes en el cromosoma 11.