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Bactériologie - Coggle Diagram
Bactériologie
Anatomie de la bactérie
Paroi bactérienne
Gram + : paroi peptidoglycane épais
Gram - : paroi peptidoglycane fine et paroi phospholipidique externe
Coloration de Gram
Gram + : l'alcool ne pénètre pas à travers la paroi épaisse donc pas de décoloration, ni de réaction à la coloration par safranine
Gram - : réaction à ces 2 étapes
Cocci
forme ronde, associables
Gram +
Staphylococcus
streptococcus (penumocoques)
enterococcus
Streptococcus pneumoniae
Epidémiologie
Réservoir : sphère ORL
Infections ORL otites sinusites
Pneumonie aiguë, surinfection bronchique secondaire à infection virale
Septicémie
Méningite
Forme foudroyante chez personnes immunodéprimées
Vaccin : Prevenar
Staphylococcus aureus
Pouvoir pathogène
bactérie versatile
colonisation
infections localisées
infections profondes
septicémies
intoxication alimentaire
infection du matériel
Epidémiologie
Réservoir : essentiellement humain, surtout fosses nasales
Transmission directe par lésion ouverte
Transmission indirecte (résistance au milieu extérieur, manuportage)
Intoxications alimentaires
Bactérie multi-résistante (BRM)
Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM)
résistance à toutes les béta-lactamines
Steptococcus
Groupe A S. pyogenes
strictement humain, fragile, peu de survie extérieure
angine, infections cutanées, érysipèle, scarlatine, rhumatisme articulaire aigu (RAA), glomérulonéphrites aiguës
Groupe B S. agalactiae
intestin et tractus génital humain/animal
infections materno-foetales (septicémies, méningites néonatales)
Groupe C, G, F
commensales du pharynx
Groupe D
voies digestives, muqueuses génito-urinaires et peau
Enterococcus
E. faecalis
E. faecium
Réservoirs : tractus digestif, voies urogénitales, éventuellement peau
Faiblement pathogène, infections urinaires, biliaires, endocardites, septicémies
BHRe
E. faecium = enterocoques résistants à la vancomycine (ERV)
Epidémies hospitalières
Gram -
Neisseria
Neisseria meningitidis
Réservoir strictement humain : rhynopharinx
transmission directe par gouttelettes salivaires
pouvoir pathogène chez < 25 ans
septicémie (purpura fulminans)
méningite cérébrospinale
Prophylaxie : traitement par rifampicine (ATB), vaccination
Bortadella pertussis
agent de la coqueluche
sécrétions des voies aériennes supérieures
toux quinteuse
Vaccin
Bacilles
forme de batonnet
Gram +
Bacillus
Listeria
Corynebacterium
Actinomyces
Listeria monocytogenes
saprophyte largement répandu (fromage, charcuterie)
survie à basse température
patients immunodéprimés, femmes enceintes, nouveaux-nés
maladie rare < 300 cas / an
mortalité 25-30% et risque de séquelles neurologiques
Gram -
Entérobactéries
Pseudonomas
Acinetobacter
Haemophilus
Bacille pyocyanique Pseudomonas aeruginosa
bactérie ubiquitaire, saprophyte de l'environnement (eau, sol, végétaux)
pathogène chez les malades fragiles
infections très variables : pulmonaires, urinaires, ostéoarticulaires, ORL, septicémie, etc.
Entérobactéries/entérobactérales
centaines d'espèces différentes
nombreuses infections opportunistes et graves (fièvre typhoïde, dysenterie bacillaire, peste, etc.
Salmonella, Shigella, Yersinia, E. Coli, etc.
BMR EBLSE
BHRe EPC
Bactéries ne réagissant aucunement à la coloration de Gram (paroi plus épaisse que les Gram +)
Bactéries spiralées (treponema, borrelia, leptospira)
Mycobactéries (réagissent à la coloration de Ziehl)
Chlamydia
Ricketsiales
Bartonella
Mycoplasma et ureaplasma
Mycobacterium tuberculosis (turberculose) ou bacille de Koch
pathogène strict à l'homme
forme contagieuse et latente (tuberculose = forme contagieuse)
transmission par voie aérienne
Flagelle
mobilité
Génome bactérien
ADN chromosomique
1 seule molécule double brin très enroulée
Pili ou fimbriae
adhésion, sexualité
Capsule
couche de polysaccharides
rôle dans la virulence
utilisée dans certains vaccins
Diagnostic
Recherche d'antigènes
Sérologie
recherche d'anticorps
Syphilis, Lime
Prélèvements microbiologiques
Hémoculture
Examen cytobactériologique des urines (ECBU)
Examen cytobactériologique des crachats (ECBC)
Aspiration endo-trachéale
Liquide de lavage broncho-alvéolaire (LBA)
Coproculture
Prélèvement de plaies, pus, liquides (pleural, articulaire, ascite, liquide cérébrospinal (LCR))
Biologie moléculaire
recherche du génome bactérien (ex : RT-PCR)
Temporalité du diagnostic
J0 examen direct (Gram) et mise en culture
J1 culture + identification
J2 antibiogramme
Métabolisme respiratoire
Aérobie strict
présence d'oxygène
Legionella L. pneumophila
pneumopathie grave Légionellose
inhalation d'aérosol d'eau contaminée (pas de transmission humaine)
contamination d'ECS
Aéro-anaérobie facultatif
présence ou absence d'oxygène
Microaérophile
concentration d'oxygène 5%
Gram -
Helicobacter
Cambylobacter
Anaérobie strict
absence d'oxygène
Gram +
Clostridium
Peptostreptococcus
Proprionibacterium
Bifidobacterium
Clostridioides difficile
diarrhée post antibiotiques
colites pseudomembraneuses
seules les souches toxinogènes sont pathogènes
sporulation
épidémies hospitalières
Gram -
Bacteroïdes
Fusobacterium
Veillonella
Température de croissance
20-45°C
bactéries mésophiles
35-70°C
bactéries thermophiles
0-25°C
bactéries psychrophiles
Sporulation uniquement pour Bacillus et Clostridium
mécanisme de survie au froid/chaleur/dessication ou désinfectants/antiseptiques/antibiotiques
Reproduction par fission binaire ou scissiparité