Gerlach je najznámejší svojou spoluprácou s Ottom Sternom na Stern-Gerlachovom experimente v roku 1922. Tento experiment bol prvým, ktorý dokázal priestorové kvantovanie magnetického momentu atómu. V experimente sa použila pec, v ktorej sa striebro zahriavalo na teplotu 1000 °C. Zväzok neutrónových atómov, ktorý z pece unikal, bol smerovaný do nehomogénneho magnetického poľa a ďalej dopadal na sklenenú dosku. Tento experiment bol kľúčový pre rozvoj kvantovej mechaniky a pomohol vedcom lepšie pochopiť, ako sa správajú častice na kvantovej úrovni1. Otto Stern bol za tento experiment ocenený Nobelovou cenou za fyziku v roku 19431. Gerlach, ako občan Tretej ríše, nemohol cenu prijať1.