Es el que controla de forma involuntaria, total o parcialmente, las funciones de las vísceras (corazón, pulmones, estómago, intestino y vejiga de la orina), la presión arterial, la producción de sudor, la producción de orina y la temperatura corporal. Está controlado por el hipotálamo y la médula espinal. Los nervios están formados casi totalmente por fibras amielínicas. Se diferencian dos tipos:
1)El Sistema Nervioso Autónomo Parasimpático. Es el que predomina en los momentos de relajación.
2)El Sistema Nervioso Autónomo Simpático. Es el que predomina en los momentos de tensión.