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生物信息学 - Coggle Diagram
生物信息学
氨基酸序列
应用场景：信息已经全部获得，明确其部分功能；已鉴定基因，对应蛋白质已了解转录谱或蛋白质组学，功能未确定
分子质量
如果是真核表达系统需要考虑糖基化因素，N-糖比较容易预测，O-糖较难预测，每个糖基化位点大于2000kDa
pI
离子交换层析柱：一般是低于pI时倾向和阳离子柱如S柱结合，高于pI时倾向和阴离子柱如Q柱结合
如果电荷分布不均匀，也会有例外，例如存在多个正电荷聚集区和多个负电荷聚集区，在相同条件下能够和阴阳离子交换柱都能结合
相同条件下，表面电荷而不是总净电荷越多，和树脂的结合越紧密，就需要更高的盐浓度进行洗脱。
蛋白在等电点溶解度最低，可以考虑等电点沉淀进行纯化
如果蛋白会和其他蛋白形成稳定的复合体那情况比较复杂，需要重新考虑
摩尔消光系数
来源：色氨酸W、酪氨酸Y、二硫键C的UV吸收峰
基于假设：暴露在表面的基团和埋在内部的基团数量平均
ε molar = (nW
5500) + (nY
1490) + (nC * 125)
如果蛋白质含有核酸污染物（或者接枝核酸），其他有吸收的物质（血红素、铁硫中心核苷酸底物、辅因子），或者荧光修饰物（例如GFP），那么这种标定方法无效
半胱氨酸含量
如果没有，就无需加入DTT等还原剂
如果来自大肠杆菌，胞质是还原环境，则半胱氨酸是还原的
如果是大肠杆菌来源并定位于周质，