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Cell signal, ligand, GTP, amplification - Coggle Diagram

- - - - 구성
        
        ligand binding domain
        
        DNA binding domain
        
        transcriptional activation domain
        
        N 말단에 존재, 특정 유전자 활성/억제
      - 역할
        
        transcription factor
        
        호르몬 유무에 따른 조절
        
        receptor은 이미 DNA와 결합
        
        absence hormone
        
        associated with corepressor
        repress transcription
        
        presence hormone
        
        associated with coactivator
        activate transcription
        
        ex thyroid hormone
        
        DNA binding 유무에 따른 조절
        
        absence hormone
        
        presence hormone
        
        ex) glucocorticoid
    - - small, hydrophobic signal molecules
      - Steroid hormone
        
        종류
        
        코르티스테로이드
        
        glucocorticoid
        
        ecdysone (insect), brassinosteroid (plant)
        
        sex hormone
        
        estrogen, progesterone, testosterone
      - Nitric oxide
        
        특징
        
        paracrine signalling
        
        local effect (unstable, short half life)
        
        nervous, immune, circulatory system
        
        diffusion으로 유입
      - 기타 : thyroid hormone, Vit D3, retynal acid, peptide hormone
  - - - Neurotransmitter
        
        종류
        
        G-protein coupled
        
        cell surface receptor 와 link
        
        metabotrophic receptor
        
        slow response
        
        second messenger system
        ex acetylcholine
        
        process
        
        neurotransmitter (first messanger) binds to receptor
        
        Activate G protein
        
        activate or inhibit enzymes
        
        produce second messanger
        
        produces other cell responses
        open/close ion channels
        
        direct coupling
        
        process
        
        Opens/closes ion channels
        
        activate G protein
        
        NT binds to receptor
        
        ligand-gated ion channel
        
        NT binding => channel open
        
        ionotropic receptor / ion channel
        
        fast response
      - peptide signalling molecules
        
        종류
        
        Growth factor
        
        신경세포 성장인자 NGF
        상피 성장인자 EGF
        혈소판 유래 성장인자 PDGF
        사이토카인
        막 부착 성장인자 ( -> 직접적 세포 상호작용)
        
        peptide hormones
        
        neuropeptide
      - eicosanoid
        
        특징
        
        빠르게 분해
        
        autocrine, paracrine
        
        lipid signaling molecule
- - - - binding mechanism
        
        receptor
        
        G protein
        
        GDP + α + β + γ
        
        .
        
        GDP
        
        G protein (active state)
        
        GTP + α + β + γ
        
        α + GTP
        
        2 more items...
        
        β + γ
        
        3 more items...
        
        receptor
        
        1 more item...
      - G protein 구조 : a helix * 7 통과
    - - receptor tyrosine kinase
        
        기능
        
        기질 단백질의 tyrosine residue를 인산화
        
        GF의 수용체
        
        세포의 생존, 분화 조절하는 신호 전달
        
        특징
        
        N-말단에 리간드가 결합할 영역 존재
        
        C-말단 : protein-tyrosine kinase activity
        
        막을 한 번만 통과하는 a-helix 구조
        
        mechanism
        
        autophosphorylation
        
        촉매 영역 내 : 타 인산화효소 활성 증가
        
        촉매 영역 밖 : 세포 내 신호를 전달하는 추가적 단백질 결합 부위
        
        이후 다른 구역에도 인산화 유도
        
        하류 신호 전달 분자 (SH2 domain, PTB domain 보유)
        가 붙어 순차적으로 신호 전달
      - nonreceptor tyrosine kinase
        
        cytokine receptor superfamily에 속하는 수용체 존재
        
        mechanism
        
        JAK / STAT 경로
        
        STAT 단백질이 수용체의 phosphotyrosine 함유 서열에 결합
        
        수용체와 결합된 JAK 타이로신 인산화효소에 의해 인산화
        
        인산화된 단백질이 dimer 형성
        
        dimer 가 핵공을 통해 핵으로 유입
        → 표적 유전자 전사 활성화
        
        사이토카인이 수용체 자극
        
        인테그린 신호전달
        
        세포가 세포 외 기질에 부착
        
        FAK (focal adhesion kinase) 활성화
        
        FAK 인산기에 SRC 결합
        
        다른 타이로신 잔기들의 인산화
        .→ 하류 신호전달분자 domain
        
        Ras (GTP binding protein) 활성화
        
        direct cell-cell signaling
        
        cadherin, IgSF 등
        
        MAP kinase 경로
        
        GF receptor -> Ras > MAP3K (Raf) > MAP2K (MEK) > MAPK (ERK)
        
        Raf, MEK가 Ras에 의해 GF receptor에 연결
        
        Ras 활성화 > Raf 단백질-세린/트레오닌 인산화효소 활성화
        
        MEK 인산화 & 활성화
        
        MEK : 이중 - 특이성 => 트레오닌과 타이로닌 모두 인산화
        
        PI 3-kinase / Akt 및 mTOR 경로
        
        kinase : JAK, Src family, ABL, FAK, lg 거대
      - linked to other enzymatic activities