Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
TRADUZIONE, 2️⃣ ALLUNGAMENTO - Coggle Diagram
TRADUZIONE
tRNA
STRUTTURA
tridimensionale
- estremità 5' P
- SITO ACCETTORE
estremità 3' OH
porta CCA seq fondamentale per caricare l'aa
- ANTICODONE tripletta funzionale all'appaimento con le triplette del messaggero = codoni
si trova nel braccio dell'anticodone
- 3 BRACCI
seq di complementarietà nucleotidica intramolecolare
= ci sono leg a H tra nucleotidi complementari
- braccio D al 5' P
- braccio variabile varia la sua lunghezza per garantire che la distanza tra aa e anticodone sia costante
- braccio ¥ contiene pseudouracile
- 3 ANSE
regione in cui manca la complementarietà
stato
- CARICO di un aa
anche detto amminoacilato
legame aa-tRNA operato da amminoacil-tRNA-sintetasi
legame estere tra gr carbossilico (aa attivato) - seq CCA (tRNA)
aa ha il gr amminico libero
-
IPOTESI del VACILLAMENTO
CODONI SINONIMI
- codificano per lo stesso aa
differiscono per il terzo nucleotide
- data la conformazione ad ansa l'interazione tra il terzo nucleotide dell'anticodone e il primo del codone può vacillare
- lo stesso tRNA può riconoscere codoni sinonimi
SINTESI PROTEICA
1️⃣ FASE ATP-DIPENDENTE
FORMAZIONE AMMINOACIL-tRNA
- amminoacil-tRNA-sintetasi è l'enzima che catalizza la reazione di amminoacilazione del tRNA
- pirofosfatasi permette la scissione del legame del PPi con liberazione di energia
ATTIVAZIONE aa
- aa e ATP sono caricati su amminoacil-tRNA-sintetasi
- enzima catalizza l'attivazione di aa la quale passa per il legame con l'AMP da cui nel frattempo si è staccato il PPi
- formazione dell'anidride mista fra COOH dell'aa e il fosfato dell'AMP (che deriva da ATP)
- tale intermedio detto amminoacil-AMP viene trasferito al tRNA con anticodone corrispondente all'aa
- formaz leg estereo tra COOH dell'aa e 3' OH del tRNA
- aa-tRNA attivato (è attivato perchè ancora legato a AMP)
- distacco di AMP e idrolisi di PPi ad opera della pirofosfatasi
- l'idrolisi dona elevata stabilità ed energia al legame aa-tRNA
(infatti nella trad NON si spende ATP) ‼️
si tratta di un legame estereo perchè deriva dalla reazione di COOH (aa) e OH (del tRNA 3')
ma NON è una reaz di CONDENSAZIONE ❌
2️⃣ FASE GTP-DIPENDENTE
TRADUZIONE EUCARIOTI
1️⃣ INIZIO
- formazione del complesso di pre-inizio =
sub min + tRNA-Met + fattori proteici di inizio
- fattori proteici riconoscono 5' UTR
- riconoscimento del cap dell'mRNA
- sub min 'scannerizza' l'mRNA (= scorre su di esso) fino alla tripletta AUG
- a questo punto tRNA iniziatore interagisce con il codone,
idrolisi di GTP
- distacco dei fattori proteici
- arrivo del tRNA iniziatore determina l'assemblaggio della sub mag
-
-
TRADUZIONE PROCARIOTI
1️⃣. INIZIO
- riconoscimento e posizionamento del ribosoma grazie a Shine e Dalgarno, seq consensus sul 5' UTR riconosciuta dall'rRNA 16S (subMin)
seq Shine e Dalgarno
è una seq di basi ripetute, complememtare ad una seq della sub min
- IF1 e IF3 consentono alla sub min di posizionarsi sull'mRNA in modo da inddividuare AUG
- IF2 media l'interazione tra il tRNA che porta la formilmetionina, il codone di inizio e la sub minore
mediante l'idrolisi di GTP
(= questa interazione prevede dispendio di GTP)
- l'interazione codone-anticodone causa una perdita di affinità di IF1 e IF3, i quali si distaccano
- la sub magg si assembla su quella minore grazie a delle modifiche strutturali su di essa
- il distacco di EF3 favorisce l'assemblaggio della sub maggiore del ribosoma
rRNA
- sub min → rRNA 16S
- sub magg → rRNA 23S e 5S
FATTORI di INIZIO
- 1 more item...
-
-
-
-
è l'enzima che catalizza la reazione di amminoacilazione del tRNA
possiede:
- sito di riconoscimento per la catena laterale dell'aa
- sito di riconoscimento per il tRNA
- sito di riconoscimento di ATP
-
- AMMINOACIL-AMP
= anidride mista
COOH (aa) + P (AMP)
- aa-tRNA
-
2️⃣ ALLUNGAMENTO
la reazione di allungamento è una reazione di TRANS-PEPTIDAZIONE, ovvero la formazione di legami peptidici
- nel Sito A entra il tRNA con il nuovo aa
- l'attività peptidil-transferasica del rRNA della subunità magg promuove la formazione del leg peptidico fra:
- NH2 dell'aa sul sito A
- COOH dell'aa sul sito P
- EGF, fattore di allungamento, favorisce lo slittamento del ribosoma mediante idrolisi di GTP
a fine traslocazione
- il sito P detiene il peptide neoformato
- il sito A è libero per accogliere il prossimo tRNA amminoacilato
- il sito E ospita il tRNA scarico
🔘
3️⃣ TERMINAZIONE
- presenza di numerosi codoni NON senso
- stimola la comparsa di fattori di rilascio, RF1, RF2 ed RF3
- RRF dissocia la sub minore dalla maggiore
3️⃣ TERMINAZIONE
- in presenza del codone di STOP il sito lega fattori di rilascio (RF1, RF2, RF3)
- il fattore di rilascio idrolizza il legame tra l'ultimo aa e il tRNA
- RRF promuove il disassemblaggio del complesso traduzionale
UTILIZZO GTP
- interazione codone-anticodone
- traslocamento del ribosoma
-
-