Please enable JavaScript.

Coggle requires JavaScript to display documents.

MAPPATURA GENETICA PROCARIOTI, I plasmidi sono tratti di cccdsDNA (double…

- - - - In questi casi può infatti avvenire una ricombinazione tra ii due diversi DNA fagici
        
        Nel caso di dimensioni molto estese possono essere anche intrageniche
- - - - 2) Fase ESPONENZIALE: fase in cui la crescita batterica cresce seguendo un andamento esponenziale dividendosi continuamente con un intervallo fisso tra le divisioni
      - 3) Fase STAZIONARIA: fase in cui la crescita raggiunge un plateau dovuto alla mancanza di spazio e nutrienti necessari per continuare la crescita al tasso precedente. Questo arriva quando c'è una densità di 1 miliardo di cellule per mL
      - 1) Fase di LATENZA: fase in cui la crescita è lenta dal momento che i batteri si stanno ancora adattando al nuovo medium di crescita
    - - Per poter mappare il genoma procarioti sono innanzitutto fondamentali i mutanti che permettono di mostrare dei fenotipi particolari differenziati tra i diversi batteri
        
        Le mutazioni possono verificarsi per 2 cause
        
        Possono accadere delle mutazioni spontanee e casuali che possono trasformare un wild-type in un mutante.
        
        In alcuni casi (rarissimi) sono presenti dei batteri mutanti detti revertanti in cui si sviluppa una seconda mutazione nello stesso punto della precedente che li fa ritornare wild-type
        
        Trattandosi di eventi puramente causali questi
        NON HANNO ALCUNA RILEVANZA NELLA MAPPATURA GENETICA
        
        Questo fa si che quindi la presenza di mutazioni presupponga che sia avvenuta una ricombinazione da cui è possibile far partire tramite diverse tecniche il MAPPAGGIO GENETICO dei batteri
        
        Possono avvenire fenomeni di RICOMBINAZIONE ovvero di scambio di materiale genetico che porta alla sostituzione di uno o più geni del battere ricevente con i geni omologhi provenienti da un ceppo geneticamente distinto
        
        Tuttavia, poichè i batteri sono aploidi, ci sono delle ristrette e specifiche situazioni in cui questo può avvenire, racchiudibili in 3 modalità di ricombinazione
        
        .
        
        .
        
        1 more item...
        
        TRASFORMAZIONE: del DNA ambientale viene incorporato all'interno del genoma batterico
        
        1 more item...
        
        TRASDUZIONE: il DNA viene trasferito da un battere all'altro usando un vettore virale
        
        1 more item...
        
        La maggior parte di tipologie di mutazioni che si andranno a prendere in considerazione sono quelle che vedono il battere perdere la possibilità di fabbricare da sè alcune molecole
        
        Questi batteri, chiamati AUXOTROFI non sono in grado di produrre molecole fondamentali per la loro vita e ciò quindi li porta a morire a meno che la molecola che non sono in grado di produrre si trovi già fatta nell'ambiente.
        I batteri che invece che riescono a prodursi tutto autonomamente si dicono PROTOTROFI
        
        Questo permette che si possa facilmente distinguere quali batteri sono mutati manipolando i terreni di coltura.
        
        I batteri che infatti riescono a crescere su terreni MINIMI ovvero terreni che possiedono solo carbonio organico e qualche ione inorganico sono prototrofi e quindi sono wild-type per tutti i geni
        
        I terreni che possiedono tutti i nutrienti necessari per vivere e su cui può quindi vivere ogni auxotrofo sono detti terreni COMPLETI.
        
        1 more item...
        
        I batteri auxotrofi necessitano di essere inseriti in un terreno di coltura che possiede le molecole per cui sono auxotrofi per vivere.
        
        Questo è dovuto alla presenza di mutazioni che quindi possono palesarsi confontando stessi batteri in medium minimi, completi e con molecole specifiche per i diversi auxotrofi.
        
        1 more item...
      - Medium semisolido di agarosio
        
        Sulle piaste di gel si sviluppano delle colonie ciascuna delle quali si è sviluppata a partire da una singola cellula batterica
        
        Contando le colonie è possibile stimare il numero di batteri presenti nella coltura di partenza
      - Medium liquido
        
        Man in mano che la crescita va avanti il liquido diventa sempre più torbido ma per fare una quantificazione più precisa bisogna piastrare i battei su terreno semisolido
- - - - Plasmidi F
        
        Questo plasmide è ciò che permette ai batteri di fare ricombinazione genica tra loro stessi, scambiandosi DNA senza dover entrare in mitosi
        
        .
        
        .
        
        I batteri in base ai rapporti che hanno con il plasmide F si dividono in:
        
        F- : questi sono batteri che non possiedono il plasmide F e sono quindi dei possibili ricettori del plasmide
        
        F+ : Questi sono batteri che presentano il plasmide in forma EPISOMIALE( non integrata nel genoma batterico). Sono dei potenziali donatori
        
        Hrf: questi sono batteri che presentano il plasmide F ma non extracromosomiali bensì, inserito all'interno del genoma del battere. Sono dei donatori ad altra frequenza.
        
        F': questo è un battere che presenta il plasmide F in forma extracromosomiale, tuttavia associato a questo ci sono anche alcuni geni che non c'entrano con il plasmide F che possono però ricombinare con il genoma batterico quando avviene la coniugazione.
        Sono dei donatori che si creano in seguito all'exicisione non perfetta del plasmide F dai batteri HRF
        
        Il plasmide contiene:
        
        .
        
        Geni necessari per la produzione del PILO F nella cellula donatrice richiesto per entrare in contatto con la cellula ricevente e trasferirle il materiale genetico
        
        Una propria origine di REPLICAZIONE a cui sono associati dei geni codificanti per le strutture e gli enzimi necessari alla replicazione
        
        Contiene anche delle sequenze di INSERZIONE che permettono al plasmide di inserirsi nel genoma batterico del ricevente
        
        Meccanismi attraverso cui avviene la CONIUGAZIONE DEL FATTORE F
        
        MECCANISMI DI TRASFERIMENTO DEL PLASMIDE NEI DIVERSI BATTERI
        
        In alcuni casi può anche verificarsi l'excisione del plasmide F dal cromosoma portando alla regressione di un battere da HFR a F+
        
        Tuttavia questa non è un semplice battere F+ dal momento che molto spesso durante l'excisione il plasmide porta con se anche alcuni geni propri del battere che quindi ne risulta privo ma che possono migrare insieme al fattore f per fare RICOMBINAZIONE.
        Per questo motivo gli F+ formatisi da excisione di HFR sono definiti F'
        
        1 more item...
        
        Trasferimento da F- a F+
        
        Nella coniugazione, grazie al PILO F si forma una vero e proprio continuum citoplasmatico tra la cellula ricevente e quella donatrice
        
        1 more item...
        
        C'è anche la possibilità, grazie a delle sequenze di inserzione (IS2 e IS3), per il plasmide F di non restare episomiale ma di integrarsi all'interno del genoma batterico.
        
        Queste cellule a questo punto prendono il nome di HFR dal momento che aumenta la in modo ancora maggiore la possibilità che avvenga trasferimento del DNA.
        
        1 more item...
      - Plasmidi che veicolano la capacità di sintetizzare COLICINE che possono uccidere i batteri limitrofi
    - - Questi sono costituiti da:
        
        RTF: il fattore di trasferimento della resistenza
        
        Determinanti R
        
        Geni che servono effettivamente a rendere il battere resistente a un dato antibiotico.
        
        Ovvero il gene che codifica per il fattore essenziale al trasferimento in sè del plasmide tramite coniugazione