Spliceosoma menor :Es parecido al Spliceosoma mayor aunque los intrones eliminados mediante este mecanismo son pocos, y además presentan diferencias en los sitios de corte y unión . También se diferencian en las secuencias consenso reconocidas, que en este caso son AU y AC para los extremos 3’ y 5’, respectivamente. Además, salvo la partícula snRNP U5, el resto son análogos funcionales denominadas U11 (análogo funcional de la U1), U12 (U2), U4atac (U4) y U6atac(U6).