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NGS - Coggle Diagram
NGS
SEGÚN MÉTODO DE SECUENCIACIÓN
PIROSECUENCIACIÓN
No usa fluoroforos
Marca:454 ROCHE
Adición de nucleótido genera BIOLUMINISCENCIA(enzima LUCIFERSA)
POR LIGACIÓN
No usa POLIMERASA(usa una LIGASA)
marca: SOLID
en desuso: solo sirve para secuencias cortas(50bp) y errores en palíndromos
secuenciación en escalera por ligación de adaptadores
POR SEMICONDUCTORES
MARCA: ION TORRENT
detección electroquímica por variación de pH al añadir el nucleotido
ventaja: nucleótido naturales , sin láseres, sin fluorófotos
POR REVERSIÓN DEL TERMINADOR(CRT:CYCLIC REVERSIBLE TERMINATION)
MARCA:ILLUMINa
Nucleótido con extremo 3 bloqueado
Eliminación fluoróforo genera una señal y deja libre al nucleótido para seguir la reacción
SEGÚN AMPLIFICACIÓN DE ADN
PCR EN EMULSIÓN(emPCR)
MICRORREACTORES= ESFERAS CIN PRIMERS
SECUENCIADORES: 454 ROCHE,SOLID
PCR EN PUENTE(BRIDGE)
SECUENCIADOR ILLUMINA