NGS
SEGÚN AMPLIFICACIÓN DE ADN
PCR EN EMULSION (emPCR)
PCR EN PUENTE (BRIDGE)
SECUENCIADOR ILLUMINA
MICRORREACTORES = ESFERAS CON PRIMERS
SECUENCIADORES: 454 ROCHE, SOLID
SEGUN METODO DE SECUENCIACION
PIROSECUENCIACIÓN
No usa fluoroforos
Marca: 454 ROCHE
Adición de nucleotido genera BIOLUMINISCENCIA (enzima LUCIFERASA
POR LIGACION
No usa POLIMERASA (usa una LIGASA)
Marca: SOLID
Secuenciación en escalera por ligación de adaptadores
en desuso: solo sirve para secuencias cortas (50 bp) y errores en palíndromos
POR SEMICONDUCTORES
MARCA: ION TORRENT
Detección electroquímica por variación de pH al añadir un nucleotido
Ventaja: nucleotidos naturales, sin lastres, sin fluoruros
POR REVERSIÓN DEL TERMINADOR (CRT: CYCLIC REVERSIBLE TERMINATION)
MARCA: ILUMINA
Nucleotido con extremo 3 bloqueado
Eliminación fluoroforo genera una señal y deja libre al nucelotido para seguir la reacción