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NGS (next generation sequencing) - Coggle Diagram
NGS (next generation sequencing)
SEGUN AMPLIFICACION ADN
PCR EN EMULSION (emPCR)
MICRORREACTORES = ESFERAS CON PRIMERS
SECUENCIADORES: 454 ROCHE // SOLID
PCR EN PUENTE (BRIDGE)
SECUENCIADOR ILLUMINA
SEGUN EL METODO DE SECUENCIACION
PIROSECUENCIACION
NO USA FLOROFOROS
MARCA: 454 ROCHE
ADICION DE NUCLEOTIDOS GENERA BIOLUMINISCENCIA (enzima luciferasa)
POR LIGACION
NO USA POLIMERASA, USA UNA LIGASA
MARCA: SOLID
SECUENCIACION EN ESCALERA POR LIGACION DE ADAPTADORES
ESTA EN DESUSO: SOLO SIRVE PARA SECUENCIAS CORTAS (50 bp) Y GENERA ERRORES EN PALINDROMOS
POR SEMICONDUCTORES
MARCA: ION TORRENT
DETECCION ELECTROQUIMICA POR VARIACION DE pH AL AÑADIR EL NUCLEOTIDO
VENTAJA: NUCLEOTIDOS NATURALES, SIN LASERES, SIN FLUOROFOROS
POR REVERSION DEL TERMINADOR (CRT: CYCLIC REVERSIBLE TERMINATION)
MARCA: ILLUMINA
NUCLEOTIDO CON EXTREMO 3' BLOQUEADO
ELIMINACION FLUOROFORO GENERA UNA SEÑAL Y DEJA LIBRE AL NUCLEOTIDO PARA SEGUIR LA REACCION