Please enable JavaScript.

Coggle requires JavaScript to display documents.

ELEMENTI TRASPONIBILI - Coggle Diagram

- - - - Questi sono estremamente regolati: infatti i trasposoni riescono sia a limitare il numero di proprie copie, sia a scegliere dei siti la cui alterazione sarebbe eccessivamente pericolosa per l'ospite
      - La mobilità dei trasposoni nella linea germinale aumenta le probabilità di avere organismi con nuove caratteristiche che possono rivelarsi vincenti in rapporto alle condizioni ambientali
  - - - RETROTRASPOSONI: sono sequenze caratterizzate da delle Long terminal repeat (LTR) sia al 5' che al 3' che posseggono al loro interno dei promotori e delle sequenze regolative.
        Anche questi elementi dovrebbero avere, considerato il meccanismo delle sequenze ripetute e invertite (credo, deduzione tua).
        
        All'interno della vera e propria sequenza del gene sono inoltre presenti le sequenze necessarie per la produzione di due proteine: TRASPOSASI e TRASCRITTASI INVERSA.
        
        Queste sono necessarie dal momento che questo tipo di trasposizione non prevede lo spostamento del DNA ma una sua "retrosintesi"
        
        Quando la sequenza genica viene trascritta e, tradotta la TRASCRITTASI INVERSA appena prodotta genera un cDNA dall'RNA che era stato trascritto dal retrotrasposoma.
        
        Questo cDNA torna ad essere a doppio filamento grazie a una DNA pol. e poi la TRASPOSASI (che era stata tradotta insieme alla trascrittasi inversa) taglia un sito a caso del DNA che diventa il sito di arrivo della trasposizione.
        
        Sempre la trasposasi (credo, lui generico) taglia un dinucleotide dalle estremità del dsDNA per facilitarne l'inserizione nel sito di arrivo. Questo però anche qui genera dei gap che devono essere riempiti dalla DNA pol generando anche qui sequenze ripetute e invertite (questo non detto ma dall'immagine sembra questo)
        
        1 more item...
        
        Il meccanismo di questo tipo di elementi trasponibili è molto simile a quello di una classe di virus: i RETROVIRUS che immettono nell'ospite materiale genetico che tra le altre cose trascrive per la trascrittasi inversa e così si genera prima un ssDNA e poi un dsDNA che si integra all'interno del DNA dell'ospite facendo in modo che quindi questo DNA venisse replicato passivamente.
    - - Possono esserci anche altre proteine come la reistenza a degli antibiotici (trasferimento genetico orizzontale)
      - Due meccanismi diversi
        
        Meccanismo senza replicazione: taglia e incolla
        
        Quando la sequenza del trasposone viene trascritta, con i geni al suo interno viene trascritta e tradotta anche la trasposasi
        
        2 trasposasi riconoscono le sequenze ripetute e invertite, vi si legano, per poi legarsi tra loro, formando il COMPLESSO SINAPTICO: struttura in cui il DNA è forzato ad assumere una forma a forcina quasi circolare
        
        Le due trasposasi a questo punto tagliano i DNA e lo spostano in un punto casuale del genoma.
        
        Perchè possa avvenire l'inserzione le trasposasi praticano un taglio all'interno del doppio filamento di arrivo, ma tagliano in modo sfalsato i due filamenti, ovvero i tagli sui due filamenti sono fatti a qualche nucleotide di distanza così a un'estremità si crea un 5' più lungo e all'altra un 3' più lungo.
        
        1 more item...
        
        Meccanismo con replicazione
        
        In questo meccanismo una sequenza trasponibile si inserisce all'interno di un plasmide accettore facendo in modo che vi sia anche l'inserzione del plasmide di cui la sequenza faceva parte all'interno del plasmide ricevente.
        
        Questo avviene perché, in seguito a tagli sfalsati dei due filamenti nel plasmide donatore e accettore si forma una struttura simile a una FORCA REPLICATIVA che permette la duplicazione dell'elemento trasponibile e poi il suo legame con le sequenze accettrici
        
        Il risultato finale è un unico plasmide in cui sono incluse sia le sequenze donatrici che le accettrici sono incluse e sono intervallate tra loro da entrambe le estremità dalle due copie di elementi trasponibili
    - - RETROTRASPOSONI IN POLI A: queste sono delle sequenze che NON presentano sequenze ripetute ed invertire alle estremità, tuttavia all'estremità 3' e 5' sono presenti delle SEQUENZE NON TRADUCIBILI e all'esterno della sequenza non traducibile al 3' si trova una SEQUENZA DI POLI-A.
        
        All'interno della sequenza inoltre vi sono anche dei geni che codificano per due proteine ORF1 e ORF2:
        
        ORF1: è una proteina che lega l'RNA
        
        ORF2: è una proteina che svolge un azione nucleasica e di retrotrascrizione
        
        Questi si traspongono nel DNA secondo un meccanismo che viene detto Trascrizione inversa innescata dal sito bersaglio che si struttura in questo modo:
        
        Una volta che il retrostrasposoma viene trascritto questo traduce per le proteine ORF1 e ORF2 che agiscono sul trascritto, e non sul DNA:
        
        ORF1 permette che l'RNA si leghi in un punto del genoma mentre ORF2 taglia in un punto qualsiasi del genoma, perchè diventi il sito di inserzione del retrotrasposone, con preferenza per sequenze ricche in T che avrebbero una maggiore affinità per la sequenza poliA dell'RNA
        
        Dopo il taglio da parte di ORF2 del sito bersaglio il 3' funge da primer per la stessa ORF2 che retrotrascrive un filamento di DNA nel sito di taglio, usando come stampo l'RNA del trasposone.
        
        1 more item...