El tratado de Libre Comercio entre Panamá y Salvador está constituidos por capítulos que incluyen una gama de aspectos: disposiciones generales, trato nacional y acceso de bienes y servicios al mercado, medidas sanitarias, reglas de origen, inversiones, solución de controversias, administración del Tratado. Incorpora temáticas, tales como: acceso de bienes al mercado, inversión, compras gubernamentales, servicios, propiedad intelectual, entrada temporal de personas de negocios, normas sanitarias y fitosanitarias, cláusulas laborales y ambientales, entre otras.
En cuanto a la composición del comercioactual entre ambos países se concentra enproductos industriales, seguido por los productos agropecuarios, agroindustriales y pesqueros para el caso de Panamá; mientras que, para El Salvador, le siguen los de tipo agroindustriales, y en menor medida pesca y agropecuario. En total, Panamá exporta hacia El Salvador a través de unas 80 fracciones arancelarias.
Dentro de los objetivos:
a) perfeccionar la zona de libre comercio;
b) estimular la expansión y diversificación del comercio de mercancías y servicios entre las Partes;
c) promover condiciones de competencia leal dentro de la zona de libre comercio;
d) eliminar las barreras al comercio y facilitar la circulación de mercancías y servicios en la zona de libre comercio;
e) promover, proteger y aumentar sustancialmente las inversiones en cada Parte
f) crear procedimientos eficaces para la aplicación y cumplimiento de este Tratado, su administración conjunta y la solución de controversias.