El entonces Reglamento Interior de la Secretaría de Gobernación, publicado en el Diario Oficial de la Federación el 13 de febrero de 1989, junto con sus reformas de 1990, 1991, 1992 y 1993, contemplaban a la Dirección General de Prevención y Readaptación Social como la instancia responsable de atender los temas relativos a las personas sujetas al sistema penitenciario, la cual sustituía a la Dirección General de Servicios Coordinados de Prevención y Readaptación Social, también dependiente de la Secretaría de Gobernación.
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