Please enable JavaScript.

Coggle requires JavaScript to display documents.

PROTEINE, DISPROTIDEMIA - Coggle Diagram

- - - - denatura proteina
        
        rinstaura la situazione iniziale
        
        nota che la proteina tende a riassumere il folding iniziale
        
        quindi il folding corretto è quello PIU' termodinamicamente favorito
  - - - alpha elica
        leg a H ogni 4 aa
        1 giro elica = 3,6 aa
        gr R all'esterno
        
        ß-struttura
        leg a H tra CO e NH di aa
        
        più ß-struttura si organizzano a formare foglietti ß tramite leg a H tra CO e NH di catene diverse
  - - - interazioni:
        
        idrofobiche (forze di van der Waals)
        
        ponti disolfuro (folding ossidativo)
        
        ioniche
        
        legami a H
    - - ripieg termodinam magg favorito = magg n. di interazioni poss
        
        DOMINI STRUTTURALI
        regioni della proteina deputate allo svolgimento di una funzione
        es. dominio catalitico, di interazione
  - - - ≠
        
        DEGRADAZIONE
        
        ROTTURA dei LEGAMI
      - PERDITA del corretto FOLDING proteico
        
        perdita della funzione proteica
- - - - deriva da:
        
        protoporfirina IX
        che costituisce un anello planare con:
        - al centro l'atomo di ferro
        - 4 anelli pirrolici
        
        da questa deriva:
        
        ferroprotoeme
        ha num ox +2 (ferro ferroso)
        stato in cui può fare 6 legami:
        - 4 leg con N della protoporfirina
        - 1 leg con istidina prossimale F8 della catena laterale dell'emoglobina
        - 1 leg libero per l'ossigeno
        
        NON lega direttamente il ferro
        conferisce alla molecola un ingombro sterico
        serve a cambiare l'angolo di legame in modo da rendero meno forte il legame tra Fe e O2 così da:
        
        favorire il rilascio di ossigeno
        
        diminuire l'affinità del CO con l'emoglobina
        
        ISTIDINA DISTALE E7
        
        gruppo EME
        
        ISTIDINA PROSSIMALE F8
        lega covalentemente il Fe
        disallineandolo dal piano dell'emoglobina
  - - - pO2 è MAX a livello dei polmoni
        -
        
        pO2 è MIN a livello tissutale
    - - ≠
        
        CIANOEMOGLOBINA
        squilibrio tra deossiemoglobina e ossiemoglobina
        
        la prevalenza della forma deossigenata porta ad uno stato di cianosi
  - - - stato TESO
        4 subunità più lontane fra loro
        stabilizzata da leg intramolecolari tra le catene globiniche
        questi sono:
        PONTI SALINI
        
        interaz idrofobiche
        
        legami ionici
        
        leg H
      - FORMA OSSIGENATA
        
        stato RILASSATO
        4 subunità vicine fra loro
        presenta maggiore affinità per O2
    - - modello SEQUENZIALE
        
        EVENTO COOPERATIVO
        
        sub a si ossigena e subisce un cambio conformazionale per l'effetto omotropico positivo dell'ossigeno
        
        questo cambio di conformazione facilita l'ossigenazione della seconda subunità
        
        e così via
        
        cosa succede quando si ossigena?
        
        sub a1 lega ossigeno e subisce un cambio conformaz
        = ovvero si rompono i PONTI SALINI che legano a1 e a2
        
        questa rottura è l'EVENTO COOPERATIVO che agevola le altre subunità ad ossigenarsi
        
        zoom in
        
        EVENTO COOPERATIVO
        
        il ferro solitamente è tirato dall'istidina prossimale
        quindi è disallineato rispetto al piano dell'emoglobina
        
        legare il primo ossigeno quindi è più difficile perchè il ferro è rientrato
        
        legame ferro-ossigeno porta ad allineare ferro e piano gr EME
        
        essendo il Fe legato a istidina il legame tira tutto il resto = rottura PONTI SALINI
        
        adesso le sub adiacenti sono favorite a legare Ossigeno
        
        a pO2 = 50 si verifica il punto di flesso il quale corrisponde ad una variazione dell'orientamento della curva dovuta all'allontanamento allosterico dell'inibitore (2,3BPG)
        4.= aumento dell'affinità per l'O2
        
        quindi il punto di flesso corrisponde allo scatto di cui si parla nel modello concertato
        
        NON si verifica il passaggio intermedio in cui l'emoglobina presenta 3 sub ossigenate
        
        📍 fase 2 = modello concertato
        
        📍 fase 1 = modello sequenziale
        
        secondo molti l'ossigenazione dell'emoglobina segue entrambi i modelli
        e si divide in due fasi:
        
        KOSHLAND
      - modello CONCERTATO
        
        avviene l'ossigenazione della prima subunità e un cambiamento improvviso
        
        poi direttamente tutte e quattro
        
        MONOD
    - - 2,3 BPG
        2,3-bifosfoglicerato
        si inserisce all'interno della struttura tridimensionale e determina la stabilizzazione della forma tesa
        
        la transizione tra forma tesa e rilassata deve avvenire per allontanamento allosterico
        
        l'espulsione dell'inibitore corrisponde al punto di flesso nella cinetica dell'emoglobina
  - - - nei POLMONI
        
        nei TESSUTI
        
        pO2 = 20mmH
        MIN
        ⬆️ [CO2]
        
        mioglobina
        è quasi tutta in forma ossigenata
        
        emoglobina
        tende a deossigenarsi
        
        rilascia il 75% di O2
        
        si lega contestualmente a BPG presenti nei globuli rossi
        
        passa dalla forma RILASSATA ➡️ TESA
        
        pO2 = 90mmHg (MAX)
        
        emoglobina
        tende a ossigenarsi
        
        lega O2
        
        rilascia contestualmente BPG
      - ad elevate altitudine
        
        pO2 tende a diminuire
        e l'organismo tende ad adattarsi:
        
        produce maggior numero di globuli rossi aumentando livelli di eritropoietina
        
        produce maggior BPG in modo tale da favorire il rilascio di O2 nei tessuti
  - - - = aumento [H+]
        
        la protonazione dell'emoglobina
        = pH acido promuove la ricostituzione dei ponti salini tra le sub dell'emoglobina
        
        ciò causa la transizione dell'emoglobina verso lo stato teso
        rilassata → teso
        
        = emoglobina tende a DEOSSIGENARSI
        
        rilascio ossigeno e rientro del BPG
        
        a livello tissutale il pH tende ad essere maggiore per la presenza di cataboliti acidi
        per cui in queste condizioni l'emoglobina adempio il compito di rilascio dell'ossigeno a livello tissutale
        
        ⬆️ pH = DEOSSIGENAZIONE dell'emoglobina
      - = aumento [H+]