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DUPLICAZIONE del DNA, . - Coggle Diagram

- - - - DNA POLIMERASI
        
        necessitano di:
        
        filamento stampo
        
        innesco contenente il 3'OH a cui aggiungere il nuovo nucleotide
        
        PROCARIOTI
        
        EUCARIOTI
        
        1. DNApol α
        allunga l'innesco di primer
        
        attività esonucleasica:
        
        3' ➡️ 5' = riparazione DNA
        
        2. DNApol ε
        duplicazione nel filamento guida
        
        attività esonucleasica:
        
        3' ➡️ 5' = riparazione DNA
        
        3. DNApol δ
        duplicazione nel filamento in ritardo
        
        attività esonucleasica:
        
        3' ➡️ 5' = riparazione DNA
        RIMOZIONE dei PRIMER 📍
        
        DUPLICAZIONE
        
        nel FILAMENTO GUIDA
        
        DNAprimasi + DNApol α
        sintesi del primer e suo allungamento
        
        PCNA + fattore di replicazione C
        favorisce scalzamento del primo complesso in favore del legame con la DNApol ε
        
        nel FILAMENTO LAGGING
        
        DNApol δ allunga il filamento
        
        rimozione inneschi: RNasi H e FEN-1 (ribonucleasi)
        l'attività esonucleasica (ribonucleasica) è ascrivibile a proteine estrinseche alla polimerasi
        
        fattori
        
        RF-C
        fattore di replicazione C
        consente al PCNA di legare il filamento stampo
        
        PCNA
        "antigene nucleare di proliferazione cellulare"
        permette alla DNApol ε / DNApol δ di agganciare il filamento stampo
        e scalzare quindi il complesso DNAprimasi + DNApol α
        
        1. DNApol I ♦️
        
        direzione di sintesi: 5' ➡️ 3'
        
        attività esonucleasica:
        
        3' ➡️ 5' = riparazione DNA
        
        5' ➡️ 3' = riempimento gap da rimozione innesco
        struttura
        SINGOLA subunità
        
        2. DNApol II
        
        direzione di sintesi: 5' ➡️ 3'
        
        attività esonucleasica: 3' ➡️ 5' = riparazione DNA
        
        3. DNApol III
        
        direzione di sintesi: 5' ➡️ 3'
        
        attività esonucleasica:
        
        3' ➡️ 5' = riparazione DNA
        
        struttura
        
        subunità ß = aggancio al filamento stampo
        
        nucleo catalitico = attività polimerasica
        
        subunità tau =
        - dominio di dimerizzazione
        - proof reading, attività esonucleasica 3'➡️5'
        
        1 more item...
        
        DUPLICAZIONE
        
        nel FILAMENTO GUIDA
        
        primasi sintetizza l'innesco
        
        DNApol III allunga il filamento
        
        nel FILAMENTO LAGGING
        
        DNApol III allunga innesco fino a quando non incontra il 5'P dell'Okazaki precedente
        .
        
        ibrido (eteroduplex) DNA-RNA destabilizza l'interazione di DNA pol III con stampo e permette lo scalzamento della DNApol III da parte della DNApol I
        .
        
        RIMOZIONE dei PRIMER 📍
        
        DNA pol I ♦️ applica contestualmente:
        
        attività esonucleasica 5'➡️3' per rimuovere il primer
        
        attività polimerasica 5'➡️3' per riempire il vuoto
        
        attività
        
        POLIMERASICA 5'➡️3'
        aggiunta, tramite l'idrolisi del pirofosfato, di un nucleotide all'estremità 3'OH del filamento in crescita
        
        ESONUCLEASICA 5'➡️3' = rimozione primer
        idrolisi al 5' del legame fosfodiestereo
        tra il primo e il secondo nucleotide
        
        ESONUCLEASICA 3'➡️5' = proofreading
        rimozione del nucleotide al 3', tramite l'idrolisi del legame fosfodiestereo tra questo e il penultimo nucleotide
  - - - complesso
        ribonucleo-proteico
        
        componente PROTEICA
        subunità TERT (Telomerase Reverse Trascriptase),
        attività reverse trascrittasica
        .
        
        componente a RNA
        subunità TERC (Telomerase RNA Component)
        
        TERC
        
        funge da STAMPO per la sintesi del DNA telomerico
        RNA ricco di adenine e citosine
        
        TERT
        
        REVERSE TRASCRITTASI
        da RNA (TERC) sintetizza DNA telomerasico (= allunga l'estremità 3' del filamento guida)
        
        DNA telomerico è complementare al TERC che è complementare a leading chain
- - - - rimuove gr metilici dalla guanina
      - ESCISSIONE di BASE (BER)
        
        nucleotide danneggiato da:
        
        ossidazione
        
        alchilazione
        
        idrolisi
        
        deaminazione
        
        meccanismo diretto
        agisce direttamente sull'errore
        = rimozione di UN SOLO nucleotide ‼️
        
        RIPARAZIONE
        
        rimozione della base azotata danneggiata ad opera di una DNAglicosilasi
        
        rimozione del suo desossiribosio fosfato ad opera di una endonucleasi
        
        DNApol ß riempie il gap
        
        DNAligasi sintetizza il leg fosfodiesterico ricostituendo la catena
        
        caso 1: DEAMINAZIONE della CITOSINA
        
        una citosina deaminata diventa U per perdita del gruppo NH2
        
        uracilDNAglicosilasi
        
        enzima che riconosce la base Uracile nel DNA e la asporta
        
        si genera così un sito privo di base detto sito abasico o sito AP ( → apurinico o apiriminico)
        
        APendonucleasi
        
        lo zucchero è asportato da una APendonucleasi
        
        DNApol e ligasi
        
        colmano il vuoto creatosi e ricuciono il filamento
        
        EU e PRO
        
        ESCISSIONE di NUCLEOTIDI (NER)
        
        lunghi filamenti di DNA danneggiati da:
        
        dimeri di timina
        
        rottura del singolo filamento
        
        = rimozione di gruppi formati da 2 a 30 nucleotidi ‼️
        
        es. dimeri di timina
        causati da raggi UV
        presenza di leg COV tra basi adiacenti causa una distorsione del fil
        che risulta in una rottura di esso
        
        elicasi srotola filamento
        
        nucleari elimina nnucletide errato
        
        DNApol sintetizza nuovo fil
        
        ligasi lega tutto
        
        alterazioni nei geni per NER
        
        xeroderma pigmentoso
        patologia dovuta all'incaoacità di correggere i dimeri di timina
        causa l'insorgenza di numerosi tumori della pelle
        
        FOTORIATTIVAZIONE
        meccanismo diretto
        nei batteri rompe il legame prodotto dai raggi UV tra basi adiacenti di timina
        
        identifica l'errore perchè provoca una distorsione nella doppia elica
        
        NON richiede filamento stampo per la riparazione
        
        RIPARAZIONE MISMATCH (MMR)
        
        interviene il sistema Mut
        
        MutS, riconosce la protrusione dall'elica dovuta all'appiamento errato
        
        MutH, usa la seq palindormica come punto di riferimento per legare il filamento neosintetizzato
        
        MutL, esplica l'attività NER
        
        RICONOSCIMENTO fil NEOSINTETIZZATO
        avviene attraverso la metilazione del DNA
        il DNA neosintetizz infatti NON è metilato
        
        PROCARIOTI
    - - espone l'individuo a:
        
        carcinogenesi
        
        senescenza cellulare
        
        apoptosi