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MATRICES DE SUSTITUCIÓN PUNTUACIÓN DE AMINOÁCIDOS - Coggle Diagram
MATRICES DE SUSTITUCIÓN PUNTUACIÓN DE AMINOÁCIDOS
BASADAS EN EXPERIMENTACIÓN
CON ALINEAMIENTOS DE SECUENCIAS CONOCIDAS
RAZON DE VEROSIMILITUD (odd-ratio)
log odd-ratio >1
cambios preferentes
log odd-ratio menor1
cambios no favorecidos
PROBABILIDAD DE QUE UNA AA CAMBIE A OTRO FRENTE A QUE LO HAGA AL HAZAR
PAM(POINT ACCEPTED MUTATIONS)
MEJOR PARA GLOBALES
CREADA POR DAYHOFF
MEJOR PARA GLOBALES
LOG ODD EN BASE 10
NOMBRE DE LA MATRIZ HACE REFERENCIA AL PORCIENTO DE MUTUACIONES EN LA SECUENCIAS
PAM250 PARA SECUENCIAS DIVERGENTES/PAM30 PARA SECUENCIAS PARECIDAS
BLOSUM(BLOCK SUBSTITUTION MATRICES
MEJOR PARA LOCALES
MEJAR PARA LOCALES
LOG ODD EN BASE 2
NOMBRE MATRIZ HACE REFERENCIA AL % DE IDENTIDAD DE LAS SECUENCIAS
PARA DIVERGENTES BLOSUM45 Y PARA PARECIDAD