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Nella cellula il DNA è associato a delle proteine in modo da formare la …

- - - - 2° livello di compattazione: l'istone H1 che non prende parte alla formazione del rocchetto lega il DNA linker (DNA che collega due nucleosomi) e un punto del doppio giro del DNA nel centro del nucleosoma. Questo stringe il DNA attorno ai nucleosomi e genera la struttura cosiddetta a filo di perle che segue un andamento a zig-zag
        
        Il 3° livello di compattazione nonchè quello presente normalmente all'interno dei nuclei in in terfase si chiama FIBRA A 30nm.
        
        Si è riuscito a cristallizzare la struttura solamente sotto forma di tetranucleosoma, tutte le informazioni derivanti riguardo strutturazione di più nucleosomi vengono esclusivamente dal microscopio elettronico. Per questo si sono ipotizzate due diverse organizzazioni di questa fibra se a forma di solenoide o, più probabilmente a forma di zig-zag
        
        Dalla struttura del tetranucleosoma si è riuscito a vedere che i nucleosomi si ritrovano impilati in coppie di due, tuttavia le diverse coppie vedono i due assi che attraverso il centro del rocchetto istonico perpendicolari tra loro
        
        4° livello di compattazione ANSA RADIALE consiste nella fibra a 30nm che si organizza ulteriormente a formare delle anse ancorate ad un supporto proteico di proteine scaffold tra cui coesine, topoisomerasi 2 e alcune proteine specifiche come le proteine di mantenimento delle strutture SMC
        
        Riepilogo: DNA di base ha larghezza di 2nm, si avvolge sull’ottamero istoniche e raggiunge dimensioni di 10nm, poi la fibra da 30nm, poi forma delle anse e si raggiungono i 300nm, si struttura ulteriormente fino a 700nm e si hanno le dimensioni del cromosoma metafasico quindi 1400nm.
        
        Questo ulteriore superavvolgimento del DNA intorno agli istoni creerebbe una tensione tale da permettere il superavvolgimento
        
        A riprova di ciò all'interno di queste anse la rimozione degli istoni porterebbe comunque ad avere un DNA superavvolto, solo in forma plectonemica. Per poter ottenere un'ansa meno avvolta e di dimensioni maggiori è necessario tagliare il doppio filamento
        
        Sembra inoltre che tutto il DNA presente all'interno di questa struttura (non ho capito se si riferisca all'ansa o a tutto lo spazzolone) venga regolato insieme dal momento che si è visto che questa struttura sembra reolare l'apertura del filamento, permettendo così una regolazione omogenea di porzioni di DNA
        
        Questo il livello di compattazione che si ritrova nella cromatina però non è omogeneo nè temporalmente (perchè la cromatina si condensa in cromosomi in metafase) nè spazialmente nella stessa interfase: difatti esistono
        
        Zone a cromatina più condensata, anche detta ETEROCROMATINA: localizzata soprattutto nei pressi della lamina nucleare e del nucleolo
        
        Questa a sua volta può essere:
        
        Costitutiva e trovarsi sempre in questa forma compatta
        
        Facoltativa avendo quindi la possibilità di passare a delle conformazioni più lasse
        
        Zone a cromatina più lassa detta EUCROMATINA disponibile quindi a essere utilizzata per la trascrizione o la replicazione. Localizzata in tutto il resto del nucleo
        
        Questa divisione spaziale della cromatina non riguarda tuttavia solo i diversi livelli di compattazione, ma tutto il nucleo interfasico: difatti anche nelle zone di eucromatina questa non si trova casualmente disposta ma si trova comunque disposta secondo TERRITORI CORMOSOMICI ovvero tutta la cromatina facente parte di un unico cromosoma (in quel momento svolto) si ritrova in un unica area di spazio
        
        L'eucromatina presente nella parte interna del nucleo si organizza in anse grazie a delle proteine che le definiscono: queste anse si ritrovano associate tra loro a formare struttura circolari insieme alle proteine necessarie alla trascrizione e sono definite FABBRICHE DI TRASCRIZIONE proprio perchè queste anse sono attivamente trascritte.
        Deduco quindi si trovino coerentemente contigue in base all'obbiettivo che la trascrizione vuole ottenere, non è detto.
        
        La divisione temporale è necessaria dal momento per poter dividere e segregare il DNA replicato è molto utile in anafase che la cromatina sia condensata nei cromosomi, tuttavia questa organizzazione non può essere mantenuta in questo modo dal momento che è necessario sia più lassa la cromatina perchè possano avvenire replicazione e trascrizione.
        
        La cromatina può quindi definirsi come una struttura DINAMICA che cambia spesso la compattazione del DNA andando a influenzare anche alcuni processi in cui il DNA è coinvolto e per questo è necessaria una fine REGOLAZIONE
        
        Questo dinamismo è dovuto alle interazioni tra DNA e gli ISTONI che possono variare, rendendo più o meno compatto il DNA in seguito all'azione di specifiche proteine dette COMPLESSI DI RIMODELLAMENTO che permettono ai nucleosomi di essere anche spostati lungo il filamento
        
        1 more item...
      - Questo porta il DNA a ridurre di 6-7 volte la sua lunghezza
      - Il rocchetto nello specifico è costituito da 24 domini ad alfa elica (3 per ogni proteina) attorno al quale si organizzano e avvolgono i 2 giri.
        
        Le interazioni che stabilizzano l'avvolgimento del DNA attorno al core istonico sono le
        
        interazioni elettrostatiche che si creano tra lo scheletro zucchero-fosfato del DNA (negativo) e le proteine istoniche (positiva), soprattutto tramite le code
        
        instaurarsi di legami a H aspecifici tra gli R degli aa degli istoni e i gruppi chimici laterali delle basi presenti in corrispondenza dei SOLCHI MINORI
      - Gli istoni sono anche caratterizzati da una serie di estremità libere che dette CODE che sporgono perpendicolarmente all'asse del rocchetto e creano una sorta di scanalatura all'interno del quale si avvolge l'elica
        
        Altra funzione delle code: la coda positiva di H4 può interagire con la regione negativa di un dimero H2A-H2B di un nucleosoma adiacente
        
        Questo permette di creare una sorta di interazione tra nucleosomi utile affinchè i nucleosomi si possano contattare tra loro per variare le loro interazioni e la compattezza della cromatina