Se puede clasificar en referencia a los niveles de organización, desde el individual, a nivel de poblaciones, de comunidades, de ecosistemas y hasta de paisajes, denominándose en cada caso: autoecología, ecología de poblaciones, de comunidades, de ecosistemas y del paisaje.
La autoecología
Analiza a los individuos en base a diferentes aspectos del ambiente como la temperatura, luz, humedad, nutrientes, entre otros
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Ecología de comunidades
Se aplica a las diferentes especies e individuos integradores de una comunidad, la composición de la misma y la relación con el entorno.
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Ecología de los paisajes
Comprende las peculiaridades estructurales y morfológicas de un territorio, así como de la evolución del mismo.
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