Pseudomonas, Achromobacter, Streptococcus, Micrococcus, Sarcina, Leuconostoc, Flavobacterium, Proteus, Escherichia, Bacillus, Clostridium, Chromobacterium, Streptomyces, Levaduras y Mohos.
La carne puede contener parásitos helmintos (cestodos y nematodos) y protozoos. Entre los cestodos destacan Cysticercus celluloseae de la Tenia solium (en el cerdo), Cysticercus bovis de la Tenia saginata (en el vacuno) o quistes de la Tenia Echinococcus granulosus. Entre los nematodos podemos señalar larvas de Trichinella spiralis y entre los protozoos a Toxoplasma gondii y Sarcocystis.