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T1AC4 - L'histoire humaine lue dans son génome, Homme de Néandertal (…
T1AC4 - L'histoire humaine lue dans son génome
Séquençage de l'ADN
Projet génome humain 1990-2003, collaboration internationale
Est. 100 000 gènes mais finalement 21 000
Méthode de séquençage de Sanger => à base de synthèse enzymatique basée sur les propriétés de l'ADN polymérase. Insertion de nucléotides fluorescentes connues qui arrêtent la synthèse de la copie de la séquence inconnue, puis tri par ordre croissant et lecture du brin compl (puis auto avec séquenceurs)
Caractéristiques du génome humain
≃ 0,1% ≠génétique humains (essentiellement SNP => 2,7 millions entre 2 humains)
certaines combi = marqueurs géographiques, permettent d'avoir une idée des origines des personnes par l'analyse de leur génome
ex: ≠ contributions génétiques au génome d'un afro-américain des US => présence d'ensembles de SNP caractéristiques de pop européenes, africaines ou amérindiennes
2% ADN codant +1/2 portions d'ADN encore inconnues
3 milliards paires de bases (ADN nucl et mito)
Histoire de l'humanité lue dans son génome
Avantages sélectifs
Certains allèles + fréquents chez certaines pop -> avantage sélectif
capacité de résistance à la peste génétiquement sélectionnée chez les pop européennes
Comparaison des séquences régulatrices du gène lactase chez phénotypes lactase persistance/non persistante sur Genigen. --> mutation de ce gène responsable, conservation pour avantages sélectifs -> combattre la pression de sélection
Séquençage génome humais disparus
Étude parenté
DAHC = dernier ancêtre hypothétique commun
Phylogène: ≠ des séquences étudiées, rapprochement des espèces les + proches et mise en évidence du DAHC
Croisements
Gène EPAS1 = héritage dénisovien chez les sapiens (mieux supporter l'altitude) => hybridation sapiens/dénisova. Allèle A1 répandue chez les tibétains grâce à la sélection naturelle. Allèle classique = A2
Comparaison de l'allèle d'un tibétain avec cell d'un dénisovien (=) sur Genigen2
Reconstitution migrations humaines
Diversité génétique comme indicateur géographique, établissement d'un graphique à partir de l'étude de 475 000 SNP ≠ chez 2244 individus dans leur région d'habitation depuis 3 générations => + éloignement berceau, - diversité génétique
étude du phénogramme sur genigen2 d'ADN mito de dénisova, sapiens, et néandertal pour confirmer leur proximité génétique (97-99%)
Homme de Néandertal (-430 000/-30 000) ->cohabité pendant 10 000 ans avec sapiens
